Process / pipelineBioinformatics / omics

Analiza wzbogacenia zestawów genów (GSEA)

Analiza wzbogacenia zestawów genów (GSEA) to metoda obliczeniowa służąca do określenia, czy z góry zdefiniowany zestaw genów – reprezentujący szlak biologiczny, proces lub funkcję – wykazuje statystycznie istotne, skoordynowane różnice między dwoma stanami biologicznymi. W przeciwieństwie do prostego filtrowania na podstawie zmiany logarytmicznej (fold-change), GSEA działa na wszystkich zmierzonych genach uszeregowanych według metryki korelacji, wykrywając subtelne, ale spójne przesunięcia w całym szlaku, nawet gdy żaden pojedynczy gen nie przekracza progu istotności.

Otwórz w MethodMindWkrótceApply, compare, get guidance

Tools & resources

Pobierz slajdy

Learn & explore

WideoWkrótce

Przeczytaj pełny opis metody

Tylko dla członków

Zaloguj się na bezpłatne konto, aby przeczytać tę sekcję.

Zaloguj się

Mapa metod

Sąsiedztwo pokrewnych metod — wybierz węzeł, aby je zgłębić.

Analiza wzbogacenia zestawów genów (GSEA)

Wieloomikowa analiza wzb…Sieciowa analiza wzbogac…Analiza wzbogacenia szla…Analiza ekspresji różnic…Analiza scRNA-seq pojedy…Bayesian Gene Set Enrich…Bayesowska analiza różno…Analiza wzbogacenia szla…Bayesowska analiza różni…Identyfikacja różnic w p…

+27 więcej

Źródła

Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
Mootha, V. K., Lindgren, C. M., Eriksson, K. F., Subramanian, A., Sihag, S., Lehar, J., Puigserver, P., Carlsson, E., Ridderstrale, M., Laurila, E., Houstis, N., Daly, M. J., Patterson, N., Mesirov, J. P., Golub, T. R., Tamayo, P., Spiegelman, B., Lander, E. S., Hirschhorn, J. N., Altshuler, D., & Groop, L. C. (2003). PGC-1alpha-responsive genes involved in oxidative phosphorylation are coordinately downregulated in human diabetes. Nature Genetics, 34(3), 267–273. DOI: 10.1038/ng1180 ↗

Jak cytować tę stronę

ScholarGate. (2026, June 3). Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/pl/bioinformatics/gene-set-enrichment-analysis

Która metoda?

Zestaw tę metodę z najbliższymi jej krewnymi i czytaj je obok siebie — biblioteka kładzie księgi na stole; wybór należy do Ciebie.

Wieloomikowa analiza wzbogacenia zestawów genówBioinformatyka↔ porównaj
Sieciowa analiza wzbogacenia zestawów genówBioinformatyka↔ porównaj
Analiza wzbogacenia szlakówBioinformatyka↔ porównaj
Analiza ekspresji różnicowej RNA-seqBioinformatyka↔ porównaj
Analiza scRNA-seq pojedynczych komórekBioinformatyka↔ porównaj

Porównaj obok siebie →

Cytowana przez

Bayesian Gene Set Enrichment Analysis Bayesowska analiza różnorodności mikrobiomu Analiza wzbogacenia szlaków bayesowskich Bayesowska analiza różnicowej ekspresji RNA-seq Identyfikacja różnic w pikach ChIP-seq Analiza wzbogacenia szlaków różnicowych Analiza eQTL Analiza wzbogacenia zbiorów genów wspomagana uczeniem maszynowym Analiza wzbogacania szlaków wspomagana uczeniem maszynowym Analiza ekspresji różnicowej RNA-seq wspomagana uczeniem maszynowym Machine learning-assisted single-cell RNA-seq analysis Analiza metabolomiczna Wieloomikowa analiza wzbogacenia zestawów genów Analiza multi-omiczna metabolomiki Analiza różnorodności mikrobiomu multi-omiczna Analiza wieloomikowa wzbogacenia szlaków Analiza proteomiczna multi-omiczna Wieloomikowa analiza ekspresji różnicowej RNA-seq Analiza wieloomowa RNA-seq pojedynczych komórek Analiza sieciowa zmienności liczby kopii Sieciowa analiza wzbogacenia zestawów genów GWAS oparty na sieciach Sieciowa analiza metabolomiczna Analiza różnorodności mikrobiomu oparta na sieciach Sieciowa analiza wzbogacenia szlaków Sieciowa analiza ekspresji różnicowej RNA-seq Sieciowa analiza danych sekwencjonowania RNA pojedynczych komórek Analiza wzbogacenia szlaków Analiza proteomiczna Analiza ekspresji różnicowej RNA-seq Analiza wzbogacenia zestawów genów w pojedynczych komórkach Analiza scRNA-seq pojedynczych komórek Single-cell RNA-seq differential expression Analiza wzbogacenia zbiorów genów w szeregach czasowych Analiza wzbogacania szlaków czasowych Analiza ekspresji różnicowej transkryptomu RNA-seq w szeregach czasowych Analiza szeregów czasowych RNA-seq pojedynczych komórek

Related reference concepts

Pathway Enrichment and Network Analysis Functional Genomics and Pathway Analysis Gene Ontology and Biological Databases Gene Expression Signatures and Prognostic Markers Transcriptomics and Gene Expression Analysis Systems Genomics and Network Biology

Widzisz błąd na tej stronie? Zgłoś go lub zaproponuj poprawkę →