Wieloomikowa analiza ekspresji różnicowej RNA-seq
Wieloomikowa analiza ekspresji różnicowej RNA-seq łączy dane o liczbie transkryptów z sekwencjonowania RNA z jedną lub więcej dodatkowymi warstwami omicznych – takimi jak proteomika, metabolomika, epigenomika lub dane o wariantach genomowych – w celu identyfikacji genów, białek lub metabolitów, które systematycznie różnią się między stanami biologicznymi. Integrując wiele poziomów molekularnych, potok wychwytuje mechanizmy regulacyjne, których sama transkryptomika nie jest w stanie rozstrzygnąć, umożliwiając pełniejszy obraz procesów biologicznych napędzających obserwowane fenotypy.
Przeczytaj pełny opis metody
Zaloguj się na bezpłatne konto, aby przeczytać tę sekcję.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Źródła
- Love, M. I., Huber, W., & Anders, S. (2014). Moderated estimation of fold change and dispersion for RNA-seq data with DESeq2. Genome Biology, 15(12), 550. DOI: 10.1186/s13059-014-0550-8 ↗
- Argelaguet, R., Velten, B., Arnol, D., Dietrich, S., Zenz, T., Marioni, J. C., Buettner, F., Huber, W., & Stegle, O. (2018). Multi-Omics Factor Analysis — a framework for unsupervised integration of multi-omics data sets. Molecular Systems Biology, 14(6), e8124. DOI: 10.15252/msb.20178124 ↗
Jak cytować tę stronę
ScholarGate. (2026, June 3). Multi-omics RNA-seq Differential Expression Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/pl/bioinformatics/multi-omics-rna-seq-differential-expression
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Analiza wzbogacenia zestawów genów (GSEA)Bioinformatyka↔ compare
Cytowana przez
Widzisz błąd na tej stronie? Zgłoś go lub zaproponuj poprawkę →