Sieciowa analiza danych sekwencjonowania RNA pojedynczych komórek
Sieciowa analiza danych sekwencjonowania RNA pojedynczych komórek (scRNA-seq) rozszerza standardowe przepływy pracy, konstruując i analizując molekularne sieci interakcji — sieci regulacji genów, sieci współekspresji lub grafy komunikacji międzykomórkowej — na podstawie danych transkryptomicznych pojedynczych komórek. Zamiast traktować każdy gen niezależnie, podejście to wychwytuje skoordynowaną aktywność obwodów genowych i szlaków sygnalizacji międzykomórkowej w obrębie populacji komórek i między nimi, umożliwiając analizę regulacji transkrypcyjnej na poziomie systemowym z rozdzielczością pojedynczej komórki.
Przeczytaj pełny opis metody
Zaloguj się na bezpłatne konto, aby przeczytać tę sekcję.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Źródła
- Aibar, S., González-Blas, C. B., Moerman, T., Huynh-Thu, V. A., Imrichova, H., Hulselmans, G., ... & Aerts, S. (2017). SCENIC: single-cell regulatory network inference and clustering. Nature Methods, 14(11), 1083–1086. link ↗
- Jin, S., Guerrero-Juarez, C. F., Zhang, L., Chang, I., Ramos, R., Kuan, C. H., ... & Nie, Q. (2021). Inference and analysis of cell-cell communication using CellChat. Nature Communications, 12(1), 1088. link ↗
Jak cytować tę stronę
ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/pl/bioinformatics/network-based-single-cell-rna-seq-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Analiza wzbogacenia zestawów genów (GSEA)Bioinformatyka↔ compare
- Sieciowa analiza ekspresji różnicowej RNA-seqBioinformatyka↔ compare
- Analiza wzbogacenia szlakówBioinformatyka↔ compare
- Analiza ekspresji różnicowej RNA-seqBioinformatyka↔ compare
- Analiza eQTL pojedynczych komórekBioinformatyka↔ compare
- Analiza scRNA-seq pojedynczych komórekBioinformatyka↔ compare
Widzisz błąd na tej stronie? Zgłoś go lub zaproponuj poprawkę →