Analiza sieciowa zmienności liczby kopii
Sieciowa analiza zmienności liczby kopii integruje dane CNV z całego genomu z sieciami interakcji biologicznych — takimi jak sieci interakcji białko-białko (PPI) lub sieci szlaków sygnałowych — w celu identyfikacji spójnych funkcjonalnie regionów, genów sterujących i zmienionych podsieci, które byłyby pominięte przez samo surowe wywoływanie CNV. Poprzez propagację sygnałów CNV przez graf sieciowy, metoda ujawnia skoordynowane zaburzenia dawki genów, które zbiegają się w wspólnych funkcjach biologicznych, co czyni ją szczególnie potężną w genomice nowotworów i badaniach rzadkich chorób.
Przeczytaj pełny opis metody
Zaloguj się na bezpłatne konto, aby przeczytać tę sekcję.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Źródła
- Vandin, F., Upfal, E., & Raphael, B. J. (2012). De novo discovery of mutated driver pathways in cancer. Genome Research, 22(2), 375–385. DOI: 10.1101/gr.120477.111 ↗
- Leiserson, M. D. M., Vandin, F., Wu, H.-T., Dobson, J. R., Eldridge, J. V., Thomas, J. L., Papoutsaki, A., Kim, Y., Niu, B., McLellan, M., Lawrence, M. S., Gonzalez-Perez, A., Tamborero, D., Cheng, Y., Ryslik, G. A., Lopez-Bigas, N., Getz, G., Ding, L., & Raphael, B. J. (2015). Pan-cancer network analysis identifies combinations of rare somatic mutations across pathways and protein complexes. Nature Genetics, 47(2), 106–114. DOI: 10.1038/ng.3168 ↗
Jak cytować tę stronę
ScholarGate. (2026, June 3). Network-Based Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/pl/bioinformatics/network-based-copy-number-variation-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Analiza zmienności liczby kopiiBioinformatyka↔ compare
- Analiza wzbogacenia zestawów genów (GSEA)Bioinformatyka↔ compare
- GWAS oparty na sieciachBioinformatyka↔ compare
- Sieciowa analiza ekspresji różnicowej RNA-seqBioinformatyka↔ compare
- Analiza wzbogacenia szlakówBioinformatyka↔ compare
- WariantyBioinformatyka↔ compare
Widzisz błąd na tej stronie? Zgłoś go lub zaproponuj poprawkę →