Analiza wieloomowa RNA-seq pojedynczych komórek — integracyjna wielomodalna profilomika pojedynczych komórek
Wieloomowa analiza RNA-seq pojedynczych komórek integruje dwie lub więcej warstw molekularnych — takich jak ekspresja genów (scRNA-seq), dostępność chromatyny (scATAC-seq) lub obfitość białek powierzchniowych (CITE-seq) — mierzone jednocześnie lub współprofilowane w tych samych indywidualnych komórkach. Dopasowując te modalności w przestrzeni o wspólnych niskich wymiarach, badacze uzyskują mechanistycznie bogatszy obraz tożsamości komórki, stanu regulacyjnego i fenotypu niż jakakolwiek pojedyncza metoda może zapewnić.
Przeczytaj pełny opis metody
Zaloguj się na bezpłatne konto, aby przeczytać tę sekcję.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Źródła
- Hao, Y., Hao, S., Andersen-Nissen, E., Mauck, W. M., Zheng, S., Butler, A., Lee, M. J., Wilk, A. J., Darby, C., Zager, M., Hoffman, P., Stoeckius, M., Papalexi, E., Mimitou, E. P., Jain, J., Srivastava, A., Stuart, T., Fleming, L. M., Yeung, B., Rogers, A. J., McElrath, J. M., Blish, C. A., Gottardo, R., Smibert, P., & Satija, R. (2021). Integrated analysis of multimodal single-cell data. Cell, 184(13), 3573–3587.e29. link ↗
- Argelaguet, R., Arnol, D., Bredikhin, D., Deloro, Y., Velten, B., Marioni, J. C., & Stegle, O. (2020). MOFA+: a statistical framework for comprehensive integration of multi-modal single-cell data. Genome Biology, 21(1), 111. link ↗
Jak cytować tę stronę
ScholarGate. (2026, June 3). Multi-omics Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/pl/bioinformatics/multi-omics-single-cell-rna-seq-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- ChIP-seq Peak CallingBioinformatyka↔ compare
- Analiza wzbogacenia zestawów genów (GSEA)Bioinformatyka↔ compare
- Wieloomikowa analiza ekspresji różnicowej RNA-seqBioinformatyka↔ compare
- Analiza wzbogacenia szlakówBioinformatyka↔ compare
- Analiza ekspresji różnicowej RNA-seqBioinformatyka↔ compare
- Analiza scRNA-seq pojedynczych komórekBioinformatyka↔ compare
Widzisz błąd na tej stronie? Zgłoś go lub zaproponuj poprawkę →