Analiza różnorodności mikrobiomu multi-omiczna
Analiza różnorodności mikrobiomu multi-omiczna integruje dwie lub więcej warstw danych omicznych – takich jak metagenomika, metatranskryptomika, metabolomika i metaproteomika – w celu scharakteryzowania zarówno składu, jak i aktywności funkcjonalnej społeczności drobnoustrojów. Łącząc metryki różnorodności taksonomicznej z danymi fenotypu molekularnego, podejście to ujawnia, w jaki sposób struktura społeczności przekłada się na funkcje ekologiczne i istotne dla gospodarza, których żadna pojedyncza warstwa omiczna nie jest w stanie samodzielnie odkryć.
Przeczytaj pełny opis metody
Zaloguj się na bezpłatne konto, aby przeczytać tę sekcję.
Mapa metod
Sąsiedztwo pokrewnych metod — wybierz węzeł, aby je zgłębić.
Źródła
- Rohart, F., Gautier, B., Singh, A., & Le Cao, K.-A. (2017). mixOmics: An R package for 'omics feature selection and multiple data integration. PLOS Computational Biology, 13(11), e1005752. DOI: 10.1371/journal.pcbi.1005752 ↗
- Argelaguet, R., Velten, B., Arnol, D., Dietrich, S., Zenz, T., Marioni, J. C., Buettner, F., Huber, W., & Stegle, O. (2018). Multi-Omics Factor Analysis — a framework for unsupervised integration of multi-omics data sets. Molecular Systems Biology, 14(6), e8124. DOI: 10.15252/msb.20178124 ↗
Jak cytować tę stronę
ScholarGate. (2026, June 3). Multi-omics Microbiome Diversity Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/pl/bioinformatics/multi-omics-microbiome-diversity-analysis
Która metoda?
Zestaw tę metodę z najbliższymi jej krewnymi i czytaj je obok siebie — biblioteka kładzie księgi na stole; wybór należy do Ciebie.
- Analiza wzbogacenia zestawów genów (GSEA)Bioinformatyka↔ porównaj
- Analiza metabolomicznaBioinformatyka↔ porównaj
- Analiza multi-omiczna metabolomikiBioinformatyka↔ porównaj
- Analiza różnorodności mikrobiomu oparta na sieciachBioinformatyka↔ porównaj
- Analiza wzbogacenia szlakówBioinformatyka↔ porównaj
Cytowana przez
Widzisz błąd na tej stronie? Zgłoś go lub zaproponuj poprawkę →