Analiza ekspresji różnicowej transkryptomu RNA-seq w szeregach czasowych — Transkryptomika czasowa

Analiza ekspresji różnicowej transkryptomu RNA-seq w szeregach czasowych identyfikuje geny, których poziomy ekspresji systematycznie zmieniają się w kolejnych punktach czasowych — na przykład podczas rozwoju, progresji choroby lub odpowiedzi na leczenie. W przeciwieństwie do analizy DE dla dwóch warunków, jawnie modeluje ona strukturę czasową danych, wychwytując dynamiczne trajektorie ekspresji genów, a nie pojedynczy kontrast migawkowy. Narzędzia takie jak maSigPro, ImpulseDE2 i splineTimeR zostały opracowane specjalnie dla tego projektu.