Wieloomikowa analiza wzbogacenia zestawów genów
Wieloomikowa analiza wzbogacenia zestawów genów (multi-omics GSEA) to potok obliczeniowy, który stosuje logikę GSEA jednocześnie do dwóch lub więcej warstw pomiarów molekularnych — takich jak transkryptomika, proteomika i metabolomika — w celu identyfikacji szlaków biologicznych lub zestawów genów, które są skoordynowanie zaburzone w różnych platformach omicznych. Integrując rangowane sygnatury molekularne z każdej warstwy, ujawnia konwergencję na poziomie szlaków, której żadna pojedyncza platforma omiczna nie mogłaby wykryć samodzielnie.
Przeczytaj pełny opis metody
Zaloguj się na bezpłatne konto, aby przeczytać tę sekcję.
Mapa metod
Sąsiedztwo pokrewnych metod — wybierz węzeł, aby je zgłębić.
Źródła
- Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
- Meng, C., Zeleznik, O. A., Thallinger, G. G., Kuster, B., Gholami, A. M., & Culhane, A. C. (2016). Dimension reduction techniques for the integrative analysis of multi-omics data. Briefings in Bioinformatics, 17(4), 628–641. DOI: 10.1093/bib/bbv108 ↗
Jak cytować tę stronę
ScholarGate. (2026, June 3). Multi-Omics Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/pl/bioinformatics/multi-omics-gene-set-enrichment-analysis
Która metoda?
Zestaw tę metodę z najbliższymi jej krewnymi i czytaj je obok siebie — biblioteka kładzie księgi na stole; wybór należy do Ciebie.
- Analiza wzbogacenia zestawów genów (GSEA)Bioinformatyka↔ porównaj
- Analiza wieloomikowa wzbogacenia szlakówBioinformatyka↔ porównaj
- Analiza wzbogacenia szlakówBioinformatyka↔ porównaj
- Analiza proteomicznaBioinformatyka↔ porównaj
- Analiza ekspresji różnicowej RNA-seqBioinformatyka↔ porównaj
- Analiza wzbogacenia zestawów genów w pojedynczych komórkachBioinformatyka↔ porównaj
Cytowana przez
Similar methods
Widzisz błąd na tej stronie? Zgłoś go lub zaproponuj poprawkę →