GWAS oparty na sieciach — badanie asocjacyjne całego genomu oparte na sieciach
GWAS oparty na sieciach integruje konwencjonalne wyniki badań asocjacyjnych całego genomu z danymi z sieci biologicznych — takimi jak sieci interakcji białko-białko (PPI) lub grafy koekspresji genów — w celu identyfikacji modułów genowych lub podsieci istotnych dla choroby. Zamiast zgłaszać tylko najlepsze pojedyncze polimorfizmy pojedynczego nukleotydu (SNP), podejście to propaguje sygnały asocjacji przez sieci interakcji molekularnych, ujawniając klastry genów, których zbiorowy sygnał wskazuje na ich udział w biologii złożonych cech, nawet jeśli żaden pojedynczy wariant nie osiąga samodzielnie istotności w skali całego genomu.
Przeczytaj pełny opis metody
Zaloguj się na bezpłatne konto, aby przeczytać tę sekcję.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Źródła
- Wang, Q., Yu, H., Zhao, Z., & Jia, P. (2015). EW_dmGWAS: edge-weighted dense module search for genome-wide association studies and gene expression profiles. Bioinformatics, 31(15), 2591–2594. link ↗
- Leiserson, M. D. M., Vandin, F., Wu, H.-T., Dobson, J. R., Eldridge, J. V., Thomas, J. L., Papoutsaki, A., Kim, Y., Niu, B., McLellan, M., Lawrence, M. S., Gonzalez-Perez, A., Tamborero, D., Cheng, Y., Ryslik, G. A., Lopez-Bigas, N., Getz, G., Ding, L., & Raphael, B. J. (2015). Pan-cancer network analysis identifies combinations of rare somatic mutations contributing to tumorigenesis. Nature Genetics, 47(2), 106–114. link ↗
Jak cytować tę stronę
ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Genome-Wide Association Study. ScholarGate. https://scholargate.app/pl/bioinformatics/network-based-gwas
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Analiza zmienności liczby kopiiBioinformatyka↔ compare
- Analiza eQTLBioinformatyka↔ compare
- Analiza wzbogacenia zestawów genów (GSEA)Bioinformatyka↔ compare
- Badanie asocjacyjne całego genomu (GWAS)Bioinformatyka↔ compare
- Analiza eQTL oparta na sieciachBioinformatyka↔ compare
- Analiza wzbogacenia szlakówBioinformatyka↔ compare
Cytowana przez
Widzisz błąd na tej stronie? Zgłoś go lub zaproponuj poprawkę →