Process / pipelineBioinformatics / omics

Analiza wzbogacenia szlaków — biologiczna analiza wzbogacenia szlaków

Analiza wzbogacenia szlaków (PEA) to podejście statystyczne, które bierze listę interesujących genów lub białek — zazwyczaj pochodzącą z eksperymentu różnicowej ekspresji lub proteomicznego — i identyfikuje, które predefiniowane szlaki biologiczne lub funkcjonalne zestawy genów są reprezentowane częściej niż oczekiwano przez przypadek. Mapując indywidualne zmiany molekularne na skatalogowane bazy wiedzy o szlakach, takie jak KEGG, Gene Ontology lub Reactome, PEA przekształca długie listy genów w zrozumiałe procesy biologiczne, czyniąc ją centralnym narzędziem w postanalizie eksperymentów omicznych na dużą skalę.

Otwórz w MethodMindWkrótceWideoWkrótcePobierz slajdy

Przeczytaj pełny opis metody

Tylko dla członków

Zaloguj się na bezpłatne konto, aby przeczytać tę sekcję.

Zaloguj się

Mapa metod

Sąsiedztwo pokrewnych metod — wybierz węzeł, aby je zgłębić.

Analiza wzbogacenia szlaków

Analiza wzbogacenia zest…Analiza metabolomiczna Sieciowa analiza wzbogac…Analiza proteomiczna Analiza ekspresji różnic…Analiza scRNA-seq pojedy…Bayesowskie wywoływanie…Analiza Bayesowska eQTL Bayesian Gene Set Enrich…Bayesian GWAS

+43 więcej

Źródła

Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
Alexa, A., Rahnenführer, J., & Lengauer, T. (2006). Improved scoring of functional groups from gene expression data by decorrelating GO graph structure. Bioinformatics, 22(13), 1600–1607. DOI: 10.1093/bioinformatics/btl140 ↗

Jak cytować tę stronę

ScholarGate. (2026, June 3). Biological Pathway Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/pl/bioinformatics/pathway-enrichment-analysis

Która metoda?

Zestaw tę metodę z najbliższymi jej krewnymi i czytaj je obok siebie — biblioteka kładzie księgi na stole; wybór należy do Ciebie.

Analiza wzbogacenia zestawów genów (GSEA)Bioinformatyka↔ porównaj
Analiza metabolomicznaBioinformatyka↔ porównaj
Sieciowa analiza wzbogacenia szlakówBioinformatyka↔ porównaj
Analiza proteomicznaBioinformatyka↔ porównaj
Analiza ekspresji różnicowej RNA-seqBioinformatyka↔ porównaj
Analiza scRNA-seq pojedynczych komórekBioinformatyka↔ porównaj

Porównaj obok siebie →

Cytowana przez

Bayesowskie wywoływanie pików ChIP-seq Analiza Bayesowska eQTL Bayesian Gene Set Enrichment Analysis Bayesian GWAS Analiza bayesowska metabolomiki Analiza wzbogacenia szlaków bayesowskich Analiza proteomiczna metodą Bayesa Bayesowska analiza różnicowej ekspresji RNA-seq Badanie różnicowe całego epigenomu (Differential EWAS)Analiza różnicowa eQTL Analiza Różnicowa Metabolomiki Analiza wzbogacenia szlaków różnicowych Analiza Proteomiczna Różnicowa Badanie asocjacyjne epigenomu (EWAS)Analiza eQTL Analiza wzbogacenia zestawów genów (GSEA)Badanie asocjacyjne całego genomu (GWAS)Analiza eQTL wspomagana uczeniem maszynowym Analiza wzbogacenia zbiorów genów wspomagana uczeniem maszynowym Analiza różnorodności mikrobiomu wspomagana uczeniem maszynowym Analiza ekspresji różnicowej RNA-seq wspomagana uczeniem maszynowym Machine learning-assisted single-cell RNA-seq analysis Analiza metabolomiczna Badanie asocjacyjne multi-omioiczne całego epigenomu Wieloomikowa analiza wzbogacenia zestawów genów Analiza multi-omiczna metabolomiki Analiza różnorodności mikrobiomu multi-omiczna Analiza proteomiczna multi-omiczna Analiza wieloomowa RNA-seq pojedynczych komórek Analiza sieciowa zmienności liczby kopii Sieciowe Epigenomowe Badanie Asocjacyjne (Network EWAS)Analiza eQTL oparta na sieciach Sieciowa analiza wzbogacenia zestawów genów GWAS oparty na sieciach Sieciowa analiza metabolomiczna Analiza różnorodności mikrobiomu oparta na sieciach Sieciowa analiza ekspresji różnicowej RNA-seq Sieciowa analiza danych sekwencjonowania RNA pojedynczych komórek Analiza proteomiczna Analiza ekspresji różnicowej RNA-seq Analiza eQTL pojedynczych komórek Analiza wzbogacenia zestawów genów w pojedynczych komórkach Single-cell GWAS Analiza metabolomiki pojedynczych komórek Analiza scRNA-seq pojedynczych komórek Single-cell RNA-seq differential expression Analiza wzbogacenia zbiorów genów w szeregach czasowych Analiza metabolomiki w szeregach czasowych Analiza różnorodności mikrobiomu w szeregach czasowych Analiza wzbogacania szlaków czasowych Analiza ekspresji różnicowej transkryptomu RNA-seq w szeregach czasowych Analiza szeregów czasowych RNA-seq pojedynczych komórek

Widzisz błąd na tej stronie? Zgłoś go lub zaproponuj poprawkę →