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Llamada de picos ChIP-seq — Llamada de picos de secuenciación por inmunoprecipitación de cromatina

La llamada de picos ChIP-seq es un flujo de trabajo computacional que identifica regiones genómicas donde una proteína de interés —un factor de transcripción o una modificación de histonas— está enriquecida, basándose en lecturas de secuenciación de experimentos de inmunoprecipitación de cromatina. Convierte datos brutos de secuenciación en un conjunto de sitios de unión o modificación de alta confianza en todo el genoma, permitiendo el análisis posterior de la regulación génica, el estado de la cromatina y los mecanismos epigenéticos.

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Fuentes

  1. Zhang, Y., Liu, T., Meyer, C. A., Eeckhoute, J., Johnson, D. S., Bernstein, B. E., Nusbaum, C., Myers, R. M., Brown, M., Li, W., & Liu, X. S. (2008). Model-based analysis of ChIP-seq (MACS). Genome Biology, 9(9), R137. DOI: 10.1186/gb-2008-9-9-r137
  2. Landt, S. G., Marinov, G. K., Kundaje, A., Kheradpour, P., Pauli, F., Batzoglou, S., Bernstein, B. E., Bickel, P., Brown, J. B., Cayting, P., Chen, Y., DeSalvo, G., Epstein, C., Fisher-Aylor, K. I., Euskirchen, G., Gerstein, M., Gertz, J., Hartemink, A. J., Hoffman, M. M., ... Snyder, M. (2012). ChIP-seq guidelines and practices of the ENCODE and modENCODE consortia. Genome Research, 22(9), 1813–1831. DOI: 10.1101/gr.136184.111

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ScholarGate. (2026, June 3). Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Peak Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/es/bioinformatics/chip-seq-peak-calling

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ScholarGateChIP-seq Peak Calling (Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Peak Calling). Recuperado el 2026-06-15 de https://scholargate.app/es/bioinformatics/chip-seq-peak-calling · Conjunto de datos: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026