Análisis de variación del número de copias en células individuales
El análisis de variación del número de copias en células individuales (scCNV, por sus siglas en inglés) detecta ganancias y pérdidas de segmentos genómicos dentro de células individuales, lo que permite a los investigadores resolver la heterogeneidad intratumoral, reconstruir la evolución clonal y distinguir células malignas de normales con resolución a nivel de célula individual. Se puede aplicar directamente a datos de secuenciación del genoma completo de células individuales o inferirse a partir de señales de profundidad de lectura en experimentos de scRNA-seq o scATAC-seq.
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Fuentes
- Garvin, T., Aboukhalil, R., Kendall, J., Baslan, T., Atwal, G. S., Hicks, J., Wigler, M., & Schatz, M. C. (2015). Interactive analysis and assessment of single-cell copy-number variations. Nature Methods, 12(11), 1058–1060. link ↗
- Gao, R., Bai, S., Henderson, Y. C., Lin, Y., Schalck, A., Yan, Y., Kumar, T., Hu, M., Sei, E., Davis, A., Wang, F., Shaitelman, S. F., Wang, J. R., Chen, K., Moulder, S., Lai, S. Y., & Navin, N. E. (2021). Delineating copy number and clonal substructure in human tumors from single-cell transcriptomes. Nature Biotechnology, 39(5), 599–608. link ↗
Cómo citar esta página
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/es/bioinformatics/single-cell-copy-number-variation-analysis
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