Llamada de picos en ChIP-seq de célula única — Perfilado epigenómico con scChIP-seq
La llamada de picos en ChIP-seq de célula única es una tubería bioinformática que identifica regiones genómicas enriquecidas con modificaciones de histonas o unión de factores de transcripción en células individuales. Al perfilar los estados de la cromatina con resolución de célula única, revela la heterogeneidad epigenómica oculta en los experimentos de ChIP-seq masivo, permitiendo a los investigadores mapear paisajes reguladores a través de distintas poblaciones celulares dentro de una muestra de tejido compleja.
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Fuentes
- Grosselin, K., Durand, A., Marsolier, J., Poitou, A., Marangoni, E., Nemati, F., ... & Vallot, C. (2019). High-throughput single-cell ChIP-seq identifies heterogeneity of chromatin states in breast cancer. Nature Genetics, 51(6), 1060-1066. link ↗
- Ku, W. L., Nakamura, K., Gao, W., Cui, K., Hu, G., Tang, Q., ... & Zhao, K. (2019). Single-cell chromatin immunocleavage sequencing (scChIC-seq) to profile histone modification. Nature Methods, 16(4), 323-325. link ↗
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ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Peak Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/es/bioinformatics/single-cell-chip-seq-peak-calling
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- Llamada de picos ChIP-seqBioinformática↔ compare
- Estudio de Asociación a Nivel de Epigenoma (EWAS)Bioinformática↔ compare
- Estudio de asociación del genoma completo de epigenoma de célula única (scEWAS)Bioinformática↔ compare
- Análisis de scRNA-seqBioinformática↔ compare
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