Analiza różnorodności mikrobiomu w szeregach czasowych — Analiza różnorodności mikrobiomu wzdłużnego
Analiza różnorodności mikrobiomu w szeregach czasowych śledzi, jak bogactwo, równomierność i skład społeczności drobnoustrojów zmieniają się w wielu punktach czasowych u tych samych osobników. Łącząc standardowe metryki różnorodności z modelami statystycznymi dla danych wzdłużnych, oddziela ona rzeczywistą dynamikę czasową od zmienności międzyosobniczej, identyfikując, kiedy i jak perturbacje, takie jak zmiany diety, leczenie antybiotykami lub początek choroby, przekształcają mikrobiom.
Przeczytaj pełny opis metody
Zaloguj się na bezpłatne konto, aby przeczytać tę sekcję.
Mapa metod
Sąsiedztwo pokrewnych metod — wybierz węzeł, aby je zgłębić.
Źródła
- Callahan, B. J., McMurdie, P. J., Rosen, M. J., Han, A. W., Johnson, A. J. A., & Holmes, S. P. (2016). DADA2: High-resolution sample inference from Illumina amplicon data. Nature Methods, 13(7), 581–583. DOI: 10.1038/nmeth.3869 ↗
- Chen, Y., Lun, A. T. L., & Smyth, G. K. (2023). Differential abundance testing on single-cell data using quasi-likelihood methods. Genome Biology, 24(1), 188. link ↗
Jak cytować tę stronę
ScholarGate. (2026, June 3). Longitudinal Microbiome Diversity Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/pl/bioinformatics/time-series-microbiome-diversity-analysis
Która metoda?
Zestaw tę metodę z najbliższymi jej krewnymi i czytaj je obok siebie — biblioteka kładzie księgi na stole; wybór należy do Ciebie.
- Analiza różnorodności mikrobiomu multi-omicznaBioinformatyka↔ porównaj
- Analiza wzbogacenia szlakówBioinformatyka↔ porównaj
- Analiza ekspresji różnicowej RNA-seqBioinformatyka↔ porównaj
- Analiza scRNA-seq pojedynczych komórekBioinformatyka↔ porównaj
- Analiza ekspresji różnicowej transkryptomu RNA-seq w szeregach czasowychBioinformatyka↔ porównaj
Similar methods
Widzisz błąd na tej stronie? Zgłoś go lub zaproponuj poprawkę →