Bayesiansk ChIP-seq toppkalling — Probabilistisk anrikningsdeteksjon i epigenomiske data

Bayesiansk ChIP-seq toppkalling anvender probabilistiske modeller — typisk Poisson, negativ binomial eller skjulte Markov-modeller med Bayesiansk inferens — for å detektere genomiske regioner anriket for et protein av interesse i kromatinimmuno-presipitering etterfulgt av sekvenseringseksperimenter. Ved eksplisitt å modellere støy i lesetall og inkludere forhåndsfordelinger, gir Bayesianske kallere posterior-sannsynligheter for anrikning i stedet for enkle p-verdier, og gir et prinsippielt rammeverk for kvantifisering av usikkerhet over hele genomet.