Process / pipelineBioinformatics / omics

Pathway Enrichment Analysis — Biológiai útvonal-bővítési analízis

A Pathway Enrichment Analysis (PEA) egy statisztikai megközelítés, amely a vizsgált gének vagy fehérjék listáját — tipikusan differenciál expressziós vagy proteomikai kísérletből származóan — veszi alapul, és azonosítja, hogy mely előre definiált biológiai útvonalak vagy funkcionális génkészletek a véletlennél gyakrabban fordulnak elő. Az egyes molekuláris változások kurált útvonal-tudásbázisokba, mint például a KEGG, Gene Ontology vagy Reactome, való megfeleltetésével a PEA hosszú génlistákat értelmezhető biológiai folyamatokká alakít át, így a nagy áteresztőképességű omikai kísérletek utólagos elemzésének központi eszközévé válik.

Megnyitás itt: MethodMindHamarosanVideóHamarosanDiák letöltése

A teljes módszer elolvasása

Csak tagoknak

Jelentkezzen be ingyenes fiókkal a szakasz elolvasásához.

Bejelentkezés

Módszertérkép

A rokon módszerek környezete — válasszon ki egy csomópontot a felfedezéshez.

Pathway Enrichment Analysis

Génkészlet-gazdagítási e…Metabolomika elemzése Hálózatalapú útvonal-gaz…Proteomikai analízis – T…RNA-seq differenciális e…Egysejtű RNS-szekvenálás…Bayesian ChIP-seq Peak C…Bayes-féle eQTL analízis Bayesian génkészlet-gazd…Bayes-faktoros GWAS

+43 további

Források

Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
Alexa, A., Rahnenführer, J., & Lengauer, T. (2006). Improved scoring of functional groups from gene expression data by decorrelating GO graph structure. Bioinformatics, 22(13), 1600–1607. DOI: 10.1093/bioinformatics/btl140 ↗

Hogyan hivatkozzon erre az oldalra

ScholarGate. (2026, June 3). Biological Pathway Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/hu/bioinformatics/pathway-enrichment-analysis

Melyik módszer?

Állítsa e módszert a hozzá legközelebb álló rokonai mellé, és olvassa őket egymás mellett — a könyvtár az asztalra teszi a könyveket; a választás az Öné.

Génkészlet-gazdagítási elemzés (GSEA)Bioinformatika↔ összehasonlítás
Metabolomika elemzéseBioinformatika↔ összehasonlítás
Hálózatalapú útvonal-gazdagítási analízisBioinformatika↔ összehasonlítás
Proteomikai analízis – Tömeghártya-alapú fehérjeprofilozásBioinformatika↔ összehasonlítás
RNA-seq differenciális expresszióBioinformatika↔ összehasonlítás
Egysejtű RNS-szekvenálási analízisBioinformatika↔ összehasonlítás

Összehasonlítás egymás mellett →

Hivatkozik rá

Bayesian ChIP-seq Peak Calling Bayes-féle eQTL analízis Bayesian génkészlet-gazdagodáselemzés (Bayesian GSEA)Bayes-faktoros GWAS Bayesian Metabolomics Analysis Bayes-féle útvonal-gazdagodáselemzés Bayes-alapú proteomikai analízis Bayes-alapú RNA-seq differenciál expresszió Differenciális Epigenom-Szintű Asszociációs Vizsgálat Differenciális eQTL analízis Differenciális Metabolomikai Elemzés Differenciális útvonal-gazdagodáselemzés Differenciálproteomikai analízis Epigenom-szintű asszociációs vizsgálat (EWAS)eQTL analízis Génkészlet-gazdagítási elemzés (GSEA)Genom-szintű asszociációs vizsgálat (GWAS)Gyakorlati gépi tanulás-alapú eQTL analízis Gépi tanulással támogatott génkészlet-gazdagodási analízis Gépi tanulással támogatott mikrobiomdiverzitás-elemzés Gépi tanulással támogatott RNA-seq differenciálexpressziós analízis Gépi tanulással támogatott egyszálú RNS-szekvencia analízis Metabolomika elemzése Multi-Omics Epigenome-Wide Association Study Multi-omikai génkészlet-gazdagítási analízis Multi-omics metabolomics analízis Multi-omics mikrobiom diverzitásanalízis Multi-omikai proteomikai analízis Multi-omics Single-Cell RNA-seq Analysis Hálózatalapú másolatszám-variációs analízis Hálózatalapú Epigenom-szintű Asszociációs Vizsgálat (Network EWAS)Hálózatalapú eQTL analízis Hálózatalapú génkészlet-gazdagítás-elemzés Hálózat-alapú GWAS – Hálózat-alapú Genom-szintű Asszociációs Vizsgálat Hálózatalapú metabolomikai analízis Hálózatalapú mikrobiom diverzitásanalízis Hálózat-alapú RNS-szekvenálás differenciális expresszió analízis Hálózatalapú egysejtű RNA-seq analízis Proteomikai analízis – Tömeghártya-alapú fehérjeprofilozás RNA-seq differenciális expresszió Single-cell eQTL Analysis Egysejtes génkészlet-gazdagodáselemzése Egysejtes GWAS Egysejtes metabolomica-analízis Egysejtű RNS-szekvenálási analízis Egysejtű RNS-szekvenálási differenciálexpressziós analízis Idősorozat génkészlet-gazdagítási analízis Time-series metabolomics analysis Idősoros mikrobiom sokféleség-elemzés Idősoros útvonal-gazdagítási analízis Differenciális expresszió idősoros RNA-seq adatokon Időkori egysejtű RNS-szekvenálási (scRNA-seq) analízis

Hibát talált ezen az oldalon? Jelentse, vagy javasoljon javítást →