Egysejtű RNS-szekvenálási analízis — scRNS-seq
Az egyszálú RNS-szekvenálási (scRNS-seq) analízis az egyes sejtek szintjén jellemzi a génexpressziót, lehetővé téve olyan sejttípusok, állapotok és átmenetek felfedezését, amelyek a tömeges transzkriptomikában láthatatlanok. A nyers szekvenálási leolvasásoktól kiindulva a munkafolyamat egy sejt-gén számláló mátrixot állít elő, majd minőségellenőrzésen, normalizáláson, dimenziócsökkentésen, felügyelet nélküli klaszterezésen, sejttípus-annotáción és számos további analízisen megy keresztül, mint például a trajektória-követés és a sejpopulationok közötti differenciál expresszió.
A teljes módszer elolvasása
Jelentkezzen be ingyenes fiókkal a szakasz elolvasásához.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
+19 more
Források
- Satija, R., Farrell, J. A., Gennert, D., Schier, A. F., & Regev, A. (2015). Spatial reconstruction of single-cell gene expression data. Nature Biotechnology, 33(5), 495–502. DOI: 10.1038/nbt.3192 ↗
- Macosko, E. Z., Basu, A., Satija, R., Nemesh, J., Shekhar, K., Goldman, M., ... & McCarroll, S. A. (2015). Highly parallel genome-wide expression profiling of individual cells using nanoliter droplets. Cell, 161(5), 1202–1214. DOI: 10.1016/j.cell.2015.05.002 ↗
Hogyan hivatkozzon erre az oldalra
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/hu/bioinformatics/single-cell-rna-seq-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Génkészlet-gazdagítási elemzés (GSEA)Bioinformatika↔ compare
- Pathway Enrichment AnalysisBioinformatika↔ compare
- RNA-seq differenciális expresszióBioinformatika↔ compare
- Single-cell eQTL AnalysisBioinformatika↔ compare
- Egysejtű variánsdetektálásBioinformatika↔ compare
Hivatkozik rá
Hibát talált ezen az oldalon? Jelentse, vagy javasoljon javítást →