Process / pipelineBioinformatics / omics

Hálózatalapú egysejtű RNA-seq analízis

A hálózatalapú egysejtű RNA-seq analízis az alap scRNA-seq munkafolyamatokat kiterjeszti molekuláris interakciós hálózatok – génszabályozó hálózatok, koexpressziós hálózatok vagy sejt-sejt kommunikációs gráfok – felépítésével és vizsgálatával, egysejtű transzkriptomikai adatokból. Ahelyett, hogy minden gént függetlenül kezelnénk, ez a megközelítés megragadja a génáramkörök és az intercelluláris jelátviteli útvonalak koordinált aktivitását a sejtpopulációkon belül és között, lehetővé téve a transzkripciós szabályozás rendszerszintű nézetét egysejtű felbontásban.

Megnyitás itt: MethodMindHamarosanVideóHamarosanDownload slides

A teljes módszer elolvasása

Csak tagoknak

Jelentkezzen be ingyenes fiókkal a szakasz elolvasásához.

Bejelentkezés

Method map

The neighbourhood of related methods — select a node to explore.

Források

  1. Aibar, S., González-Blas, C. B., Moerman, T., Huynh-Thu, V. A., Imrichova, H., Hulselmans, G., ... & Aerts, S. (2017). SCENIC: single-cell regulatory network inference and clustering. Nature Methods, 14(11), 1083–1086. link
  2. Jin, S., Guerrero-Juarez, C. F., Zhang, L., Chang, I., Ramos, R., Kuan, C. H., ... & Nie, Q. (2021). Inference and analysis of cell-cell communication using CellChat. Nature Communications, 12(1), 1088. link

Hogyan hivatkozzon erre az oldalra

ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/hu/bioinformatics/network-based-single-cell-rna-seq-analysis

Which method?

Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.

Compare side by side
ScholarGateNetwork-based single-cell RNA-seq analysis (Network-based Single-Cell RNA Sequencing Analysis). Letöltve 2026-06-15, forrás: https://scholargate.app/hu/bioinformatics/network-based-single-cell-rna-seq-analysis · Adatkészlet: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026