Hálózatalapú egysejtű RNA-seq analízis
A hálózatalapú egysejtű RNA-seq analízis az alap scRNA-seq munkafolyamatokat kiterjeszti molekuláris interakciós hálózatok – génszabályozó hálózatok, koexpressziós hálózatok vagy sejt-sejt kommunikációs gráfok – felépítésével és vizsgálatával, egysejtű transzkriptomikai adatokból. Ahelyett, hogy minden gént függetlenül kezelnénk, ez a megközelítés megragadja a génáramkörök és az intercelluláris jelátviteli útvonalak koordinált aktivitását a sejtpopulációkon belül és között, lehetővé téve a transzkripciós szabályozás rendszerszintű nézetét egysejtű felbontásban.
A teljes módszer elolvasása
Jelentkezzen be ingyenes fiókkal a szakasz elolvasásához.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Források
- Aibar, S., González-Blas, C. B., Moerman, T., Huynh-Thu, V. A., Imrichova, H., Hulselmans, G., ... & Aerts, S. (2017). SCENIC: single-cell regulatory network inference and clustering. Nature Methods, 14(11), 1083–1086. link ↗
- Jin, S., Guerrero-Juarez, C. F., Zhang, L., Chang, I., Ramos, R., Kuan, C. H., ... & Nie, Q. (2021). Inference and analysis of cell-cell communication using CellChat. Nature Communications, 12(1), 1088. link ↗
Hogyan hivatkozzon erre az oldalra
ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/hu/bioinformatics/network-based-single-cell-rna-seq-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Génkészlet-gazdagítási elemzés (GSEA)Bioinformatika↔ compare
- Hálózat-alapú RNS-szekvenálás differenciális expresszió analízisBioinformatika↔ compare
- Pathway Enrichment AnalysisBioinformatika↔ compare
- RNA-seq differenciális expresszióBioinformatika↔ compare
- Single-cell eQTL AnalysisBioinformatika↔ compare
- Egysejtű RNS-szekvenálási analízisBioinformatika↔ compare
Hibát talált ezen az oldalon? Jelentse, vagy javasoljon javítást →