Process / pipelineBioinformatics / omics

Génkészlet-gazdagítási elemzés (GSEA)

A génkészlet-gazdagítási elemzés (Gene Set Enrichment Analysis, GSEA) egy számítógépes módszer, amely meghatározza, hogy egy előre definiált génkészlet – amely egy biológiai utat, folyamatot vagy funkciót képvisel – statisztikailag szignifikáns, koordinált különbségeket mutat-e két biológiai állapot között. Az egyszerű hajtogatott változás szűrésével ellentétben a GSEA az összes mért gént rangsorolja egy korrelációs metrika alapján, észleli a finom, de következetes eltolódásokat egy teljes útvonalon keresztül, még akkor is, ha egyetlen gén sem éri el a szignifikancia küszöbértékét.

Megnyitás itt: MethodMindHamarosanApply, compare, get guidance

Tools & resources

Diák letöltése

Learn & explore

VideóHamarosan

A teljes módszer elolvasása

Csak tagoknak

Jelentkezzen be ingyenes fiókkal a szakasz elolvasásához.

Bejelentkezés

Módszertérkép

A rokon módszerek környezete — válasszon ki egy csomópontot a felfedezéshez.

Génkészlet-gazdagítási elemzés (GSEA)

Multi-omikai génkészlet-…Hálózatalapú génkészlet-…Pathway Enrichment Analy…RNA-seq differenciális e…Egysejtű RNS-szekvenálás…Bayesian génkészlet-gazd…Bayes-féle mikrobiom div…Bayes-féle útvonal-gazda…Bayes-alapú RNA-seq diff…Differenciális ChIP-seq…

+27 további

Források

Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
Mootha, V. K., Lindgren, C. M., Eriksson, K. F., Subramanian, A., Sihag, S., Lehar, J., Puigserver, P., Carlsson, E., Ridderstrale, M., Laurila, E., Houstis, N., Daly, M. J., Patterson, N., Mesirov, J. P., Golub, T. R., Tamayo, P., Spiegelman, B., Lander, E. S., Hirschhorn, J. N., Altshuler, D., & Groop, L. C. (2003). PGC-1alpha-responsive genes involved in oxidative phosphorylation are coordinately downregulated in human diabetes. Nature Genetics, 34(3), 267–273. DOI: 10.1038/ng1180 ↗

Hogyan hivatkozzon erre az oldalra

ScholarGate. (2026, June 3). Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/hu/bioinformatics/gene-set-enrichment-analysis

Melyik módszer?

Állítsa e módszert a hozzá legközelebb álló rokonai mellé, és olvassa őket egymás mellett — a könyvtár az asztalra teszi a könyveket; a választás az Öné.

Multi-omikai génkészlet-gazdagítási analízisBioinformatika↔ összehasonlítás
Hálózatalapú génkészlet-gazdagítás-elemzésBioinformatika↔ összehasonlítás
Pathway Enrichment AnalysisBioinformatika↔ összehasonlítás
RNA-seq differenciális expresszióBioinformatika↔ összehasonlítás
Egysejtű RNS-szekvenálási analízisBioinformatika↔ összehasonlítás

Összehasonlítás egymás mellett →

Hivatkozik rá

Bayesian génkészlet-gazdagodáselemzés (Bayesian GSEA)Bayes-féle mikrobiom diverzitásanalízis Bayes-féle útvonal-gazdagodáselemzés Bayes-alapú RNA-seq differenciál expresszió Differenciális ChIP-seq csúcshívás Differenciális útvonal-gazdagodáselemzés eQTL analízis Gépi tanulással támogatott génkészlet-gazdagodási analízis Gépi tanulással támogatott útvonal-gazdagítási analízis Gépi tanulással támogatott RNA-seq differenciálexpressziós analízis Gépi tanulással támogatott egyszálú RNS-szekvencia analízis Metabolomika elemzése Multi-omikai génkészlet-gazdagítási analízis Multi-omics metabolomics analízis Multi-omics mikrobiom diverzitásanalízis Multi-omics Pathway Enrichment Analysis Multi-omikai proteomikai analízis Több-omikszos RNS-seq differenciális expresszió analízis Multi-omics Single-Cell RNA-seq Analysis Hálózatalapú másolatszám-variációs analízis Hálózatalapú génkészlet-gazdagítás-elemzés Hálózat-alapú GWAS – Hálózat-alapú Genom-szintű Asszociációs Vizsgálat Hálózatalapú metabolomikai analízis Hálózatalapú mikrobiom diverzitásanalízis Hálózatalapú útvonal-gazdagítási analízis Hálózat-alapú RNS-szekvenálás differenciális expresszió analízis Hálózatalapú egysejtű RNA-seq analízis Pathway Enrichment Analysis Proteomikai analízis – Tömeghártya-alapú fehérjeprofilozás RNA-seq differenciális expresszió Egysejtes génkészlet-gazdagodáselemzése Egysejtű RNS-szekvenálási analízis Egysejtű RNS-szekvenálási differenciálexpressziós analízis Idősorozat génkészlet-gazdagítási analízis Idősoros útvonal-gazdagítási analízis Differenciális expresszió idősoros RNA-seq adatokon Időkori egysejtű RNS-szekvenálási (scRNA-seq) analízis

Related reference concepts

Pathway Enrichment and Network Analysis Functional Genomics and Pathway Analysis Gene Ontology and Biological Databases Gene Expression Signatures and Prognostic Markers Transcriptomics and Gene Expression Analysis Systems Genomics and Network Biology

Hibát talált ezen az oldalon? Jelentse, vagy javasoljon javítást →