Hálózatalapú másolatszám-variációs analízis
A hálózatalapú másolatszám-variációs (CNV) analízis integrálja a genom-szintű CNV-adatokat biológiai interakciós hálózatokkal – mint például fehérje-fehérje interakciós (PPI) vagy útvonali hálózatok – hogy olyan funkcionálisan koherens régiókat, hajtó géncsoportokat és alterált szubnetworköket azonosítson, amelyeket a nyers CNV-hívás önmagában figyelmen kívül hagyna. A CNV-jelek hálógráfon keresztüli terjesztésével a módszer koordinált genomikai dózis-beli egyensúlyzavarokat tár fel, amelyek közös biológiai funkciókban konvergálnak, így különösen erőteljes a rákkutatásban és ritka betegségek tanulmányozásában.
A teljes módszer elolvasása
Jelentkezzen be ingyenes fiókkal a szakasz elolvasásához.
Módszertérkép
A rokon módszerek környezete — válasszon ki egy csomópontot a felfedezéshez.
Források
- Vandin, F., Upfal, E., & Raphael, B. J. (2012). De novo discovery of mutated driver pathways in cancer. Genome Research, 22(2), 375–385. DOI: 10.1101/gr.120477.111 ↗
- Leiserson, M. D. M., Vandin, F., Wu, H.-T., Dobson, J. R., Eldridge, J. V., Thomas, J. L., Papoutsaki, A., Kim, Y., Niu, B., McLellan, M., Lawrence, M. S., Gonzalez-Perez, A., Tamborero, D., Cheng, Y., Ryslik, G. A., Lopez-Bigas, N., Getz, G., Ding, L., & Raphael, B. J. (2015). Pan-cancer network analysis identifies combinations of rare somatic mutations across pathways and protein complexes. Nature Genetics, 47(2), 106–114. DOI: 10.1038/ng.3168 ↗
Hogyan hivatkozzon erre az oldalra
ScholarGate. (2026, June 3). Network-Based Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/hu/bioinformatics/network-based-copy-number-variation-analysis
Melyik módszer?
Állítsa e módszert a hozzá legközelebb álló rokonai mellé, és olvassa őket egymás mellett — a könyvtár az asztalra teszi a könyveket; a választás az Öné.
- Copy Number Variation AnalysisBioinformatika↔ összehasonlítás
- Génkészlet-gazdagítási elemzés (GSEA)Bioinformatika↔ összehasonlítás
- Hálózat-alapú GWAS – Hálózat-alapú Genom-szintű Asszociációs VizsgálatBioinformatika↔ összehasonlítás
- Hálózat-alapú RNS-szekvenálás differenciális expresszió analízisBioinformatika↔ összehasonlítás
- Pathway Enrichment AnalysisBioinformatika↔ összehasonlítás
- VariánsdetektálásBioinformatika↔ összehasonlítás
Hibát talált ezen az oldalon? Jelentse, vagy javasoljon javítást →