Hálózat-alapú GWAS – Hálózat-alapú Genom-szintű Asszociációs Vizsgálat
A hálózat-alapú GWAS a hagyományos genom-szintű asszociációs vizsgálatok (GWAS) eredményeit biológiai hálózati adatokkal – például fehérje-fehérje interakciós (PPI) hálózatokkal vagy gén-koexpressziós gráfokkal – integrálja, hogy betegséggel összefüggő génmodulokat vagy alhálózatokat azonosítson. Ahelyett, hogy csak a legfontosabb egyedi SNP-ket jelentené, ez a megközelítés a molekuláris interakciós hálózatokon keresztül terjeszti az asszociációs jeleket, olyan génklasztereket tárva fel, amelyek kollektív jele komplex tulajdonságok biológiájában való részvételre utal, még akkor is, ha egyetlen variáns sem éri el önmagában a genom-szintű szignifikanciát.
A teljes módszer elolvasása
Jelentkezzen be ingyenes fiókkal a szakasz elolvasásához.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Források
- Wang, Q., Yu, H., Zhao, Z., & Jia, P. (2015). EW_dmGWAS: edge-weighted dense module search for genome-wide association studies and gene expression profiles. Bioinformatics, 31(15), 2591–2594. link ↗
- Leiserson, M. D. M., Vandin, F., Wu, H.-T., Dobson, J. R., Eldridge, J. V., Thomas, J. L., Papoutsaki, A., Kim, Y., Niu, B., McLellan, M., Lawrence, M. S., Gonzalez-Perez, A., Tamborero, D., Cheng, Y., Ryslik, G. A., Lopez-Bigas, N., Getz, G., Ding, L., & Raphael, B. J. (2015). Pan-cancer network analysis identifies combinations of rare somatic mutations contributing to tumorigenesis. Nature Genetics, 47(2), 106–114. link ↗
Hogyan hivatkozzon erre az oldalra
ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Genome-Wide Association Study. ScholarGate. https://scholargate.app/hu/bioinformatics/network-based-gwas
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Copy Number Variation AnalysisBioinformatika↔ compare
- eQTL analízisBioinformatika↔ compare
- Génkészlet-gazdagítási elemzés (GSEA)Bioinformatika↔ compare
- Genom-szintű asszociációs vizsgálat (GWAS)Bioinformatika↔ compare
- Hálózatalapú eQTL analízisBioinformatika↔ compare
- Pathway Enrichment AnalysisBioinformatika↔ compare
Hivatkozik rá
Hibát talált ezen az oldalon? Jelentse, vagy javasoljon javítást →