Egysejtes GWAS — Sejttípus-specifikus genetikai asszociációs analízis
Az egysejtes GWAS egy integratív bioinformatikai pipeline, amely a genomszintű asszociációs vizsgálatok (GWAS) jeleit egysejtes transzkriptomikai tájképekre vetíti, hogy azonosítsa, mely sejttípusok és egyedi sejtek hordoznak aránytalan genetikai kockázatot egy betegségre vagy tulajdonságra nézve. Az egysejtes RNS-szekvenálási atlaszok és a GWAS összefoglaló statisztikák együttes felhasználásával túllép a szöveti szintű asszociációkon, és feltárja azokat a pontos celluláris kontextusokat, amelyekben a betegséggel összefüggő genetikai variánsok kifejtik hatásukat.
A teljes módszer elolvasása
Jelentkezzen be ingyenes fiókkal a szakasz elolvasásához.
Módszertérkép
A rokon módszerek környezete — válasszon ki egy csomópontot a felfedezéshez.
Források
- Zhang, M. J., Hou, K., Dey, K. K., Sakaue, S., Jagadeesh, K. A., Weinand, K., ... & Price, A. L. (2022). Polygenic enrichment distinguishes disease associations of individual cells in single-cell RNA-seq data. Nature Genetics, 54(8), 1224-1234. link ↗
- Bryois, J., Calini, D., Macnair, W., Foo, L., Urich, E., Ortmann, W., ... & De Jager, P. L. (2022). Cell-type-specific cis-eQTLs in eight human brain cell types identify novel risk genes for psychiatric and neurological disorders. Nature Neuroscience, 25(8), 1104-1112. link ↗
Hogyan hivatkozzon erre az oldalra
ScholarGate. (2026, June 3). Single-Cell Genome-Wide Association Study. ScholarGate. https://scholargate.app/hu/bioinformatics/single-cell-gwas
Melyik módszer?
Állítsa e módszert a hozzá legközelebb álló rokonai mellé, és olvassa őket egymás mellett — a könyvtár az asztalra teszi a könyveket; a választás az Öné.
- eQTL analízisBioinformatika↔ összehasonlítás
- Genom-szintű asszociációs vizsgálat (GWAS)Bioinformatika↔ összehasonlítás
- Pathway Enrichment AnalysisBioinformatika↔ összehasonlítás
- RNA-seq differenciális expresszióBioinformatika↔ összehasonlítás
- Single-cell eQTL AnalysisBioinformatika↔ összehasonlítás
- Egysejtű RNS-szekvenálási analízisBioinformatika↔ összehasonlítás
Hivatkozik rá
Hibát talált ezen az oldalon? Jelentse, vagy javasoljon javítást →