Hálózatalapú útvonal-gazdagítási analízis
A hálózatalapú útvonal-gazdagítási analízis molekuláris interakciós hálózatokat – fehérje-fehérje kölcsönhatásokat, jelátviteli gráfokat vagy génszabályozási hálózatokat – integrál omikai mérésekkel, hogy azonosítsa azokat a biológiai útvonalakat, amelyek egy adott állapotban koordináltan megváltoztak. Ellentétben a klasszikus túlreprezentációs vagy génkészlet-gazdagítási megközelítésekkel, amelyek az útvonalak génjeit független listákként kezelik, ez a módszercsalád a jeleket a hálózati éleken keresztül terjeszti, megragadva az interakciók topológiáját, és olyan diszregulált modulokat tár fel, amelyeket a síklistás gazdagítás elszalasztana.
A teljes módszer elolvasása
Jelentkezzen be ingyenes fiókkal a szakasz elolvasásához.
Módszertérkép
A rokon módszerek környezete — válasszon ki egy csomópontot a felfedezéshez.
Források
- Ideker, T., Ozier, O., Schwikowski, B., & Siegel, A. F. (2002). Discovering regulatory and signalling circuits in molecular interaction networks. Bioinformatics, 18(suppl_1), S233–S240. link ↗
- Vaske, C. J., Benz, S. C., Sanborn, J. Z., Earl, D., Szeto, C., Zhu, J., Haussler, D., & Stuart, J. M. (2010). Inference of patient-specific pathway activities from multi-dimensional cancer genomics data using PARADIGM. Bioinformatics, 26(12), i237–i245. DOI: 10.1093/bioinformatics/btq182 ↗
Hogyan hivatkozzon erre az oldalra
ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Pathway Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/hu/bioinformatics/network-based-pathway-enrichment-analysis
Melyik módszer?
Állítsa e módszert a hozzá legközelebb álló rokonai mellé, és olvassa őket egymás mellett — a könyvtár az asztalra teszi a könyveket; a választás az Öné.
- Génkészlet-gazdagítási elemzés (GSEA)Bioinformatika↔ összehasonlítás
Hivatkozik rá
Hibát talált ezen az oldalon? Jelentse, vagy javasoljon javítást →