Bayesian ChIP-seq Peak Calling — Valószínűségi alapú dúsulásdetektálás epigenomikai adatokban

A Bayesian ChIP-seq peak calling valószínűségi modelleket – tipikusan Poisson, negatív binomiális vagy rejtett Markov-modelleket Bayes-féle következtetéssel – alkalmaz a kromatinimmunprecipitációt követő szekvenálási (ChIP-seq) kísérletekben az érdeklődésre számot tartó fehérje által dúsított genom régiók kimutatására. Az olvasatszámlálási zaj explicit modellezésével és az előzetes eloszlások (prior distributions) beépítésével a Bayesian megközelítésű programok egyszerű p-értékek helyett a dúsulás utólagos valószínűségeit (posterior probabilities) adják meg, ami egy elvileg megalapozott keretrendszert biztosít a bizonytalanság kvantifikálásához az egész genomra vonatkozóan.