Idősoros mikrobiom sokféleség-elemzés — Hosszanti irányú mikrobiom sokféleség-elemzés
Az idősoros mikrobiom sokféleség-elemzés követi, hogyan változik a mikrobiális közösségek gazdagsága, egyenlősége és közösségi összetétele több időponton keresztül ugyanazon alanyokon belül. A standard sokféleségi mutatók és a hosszanti statisztikai modellek kombinálásával elkülöníti a valódi időbeli dinamikát az egyéni eltérésektől, azonosítva, hogy mikor és hogyan alakítják át a mikrobiomot olyan perturbációk, mint étrendi változások, antibiotikumos kezelés vagy betegség fellépése.
A teljes módszer elolvasása
Jelentkezzen be ingyenes fiókkal a szakasz elolvasásához.
Módszertérkép
A rokon módszerek környezete — válasszon ki egy csomópontot a felfedezéshez.
Források
- Callahan, B. J., McMurdie, P. J., Rosen, M. J., Han, A. W., Johnson, A. J. A., & Holmes, S. P. (2016). DADA2: High-resolution sample inference from Illumina amplicon data. Nature Methods, 13(7), 581–583. DOI: 10.1038/nmeth.3869 ↗
- Chen, Y., Lun, A. T. L., & Smyth, G. K. (2023). Differential abundance testing on single-cell data using quasi-likelihood methods. Genome Biology, 24(1), 188. link ↗
Hogyan hivatkozzon erre az oldalra
ScholarGate. (2026, June 3). Longitudinal Microbiome Diversity Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/hu/bioinformatics/time-series-microbiome-diversity-analysis
Melyik módszer?
Állítsa e módszert a hozzá legközelebb álló rokonai mellé, és olvassa őket egymás mellett — a könyvtár az asztalra teszi a könyveket; a választás az Öné.
- Multi-omics mikrobiom diverzitásanalízisBioinformatika↔ összehasonlítás
- Pathway Enrichment AnalysisBioinformatika↔ összehasonlítás
- RNA-seq differenciális expresszióBioinformatika↔ összehasonlítás
- Egysejtű RNS-szekvenálási analízisBioinformatika↔ összehasonlítás
- Differenciális expresszió idősoros RNA-seq adatokonBioinformatika↔ összehasonlítás
Similar methods
Hibát talált ezen az oldalon? Jelentse, vagy javasoljon javítást →