ScholarGate
ผู้ช่วย
Process / pipelineBioinformatics / omics

Gene Set Enrichment Analysis (GSEA)

Gene Set Enrichment Analysis (GSEA) เป็นวิธีการคำนวณที่กำหนดว่าชุดของยีนที่กำหนดไว้ล่วงหน้า — ซึ่งแสดงถึงวิถีชีวภาพ กระบวนการ หรือหน้าที่ — แสดงความแตกต่างที่ประสานกันอย่างมีนัยสำคัญทางสถิติระหว่างสภาวะทางชีวภาพสองสภาวะ แตกต่างจากการกรองแบบ fold-change อย่างง่าย GSEA ดำเนินการกับยีนที่วัดได้ทั้งหมดที่จัดอันดับตามตัวชี้วัดความสัมพันธ์ ตรวจจับการเปลี่ยนแปลงที่ละเอียดอ่อนแต่สม่ำเสมอทั่วทั้งวิถีทั้งหมด แม้ว่าจะไม่มีการทดสอบยีนเดี่ยวใดผ่านเกณฑ์นัยสำคัญก็ตาม

เปิดใน MethodMindเร็ว ๆ นี้วิดีโอเร็ว ๆ นี้ดาวน์โหลดสไลด์

อ่านวิธีฉบับเต็ม

สำหรับสมาชิกเท่านั้น

เข้าสู่ระบบด้วยบัญชีฟรีเพื่ออ่านส่วนนี้

เข้าสู่ระบบ

แผนที่ระเบียบวิธี

ย่านของระเบียบวิธีที่เกี่ยวข้องกัน — เลือกโหนดเพื่อสำรวจ

+27 เพิ่มเติม

แหล่งอ้างอิง

  1. Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102
  2. Mootha, V. K., Lindgren, C. M., Eriksson, K. F., Subramanian, A., Sihag, S., Lehar, J., Puigserver, P., Carlsson, E., Ridderstrale, M., Laurila, E., Houstis, N., Daly, M. J., Patterson, N., Mesirov, J. P., Golub, T. R., Tamayo, P., Spiegelman, B., Lander, E. S., Hirschhorn, J. N., Altshuler, D., & Groop, L. C. (2003). PGC-1alpha-responsive genes involved in oxidative phosphorylation are coordinately downregulated in human diabetes. Nature Genetics, 34(3), 267–273. DOI: 10.1038/ng1180

วิธีอ้างอิงหน้านี้

ScholarGate. (2026, June 3). Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/th/bioinformatics/gene-set-enrichment-analysis

ระเบียบวิธีใด?

วางระเบียบวิธีนี้เคียงข้างระเบียบวิธีใกล้เคียงที่สุด แล้วอ่านเปรียบเทียบกัน — คลังวางหนังสือไว้บนโต๊ะให้แล้ว ส่วนการเลือกเป็นของท่าน

เปรียบเทียบเคียงข้างกัน

ถูกอ้างอิงโดย

Bayesian Gene Set Enrichment Analysisการวิเคราะห์ความหลากหลายของจุลินทรีย์แบบเบย์เซียนการวิเคราะห์การเสริมเส้นทางชีวภาพแบบเบย์ (Bayesian Pathway Enrichment Analysis)Bayesian RNA-seq differential expressionการหาตำแหน่ง ChIP-seq Peak แบบจำเพาะการวิเคราะห์การเสริมเส้นทางที่แตกต่างกันการวิเคราะห์ eQTLการวิเคราะห์การเสริมสร้างกลุ่มยีนโดยใช้การเรียนรู้ของเครื่องการวิเคราะห์การเสริมเส้นทางชีวภาพโดยใช้การเรียนรู้ของเครื่องMachine learning-assisted RNA-seq differential expressionการวิเคราะห์ข้อมูล RNA ลำดับเซลล์เดี่ยวด้วยการเรียนรู้ของเครื่องการวิเคราะห์เมแทบอโลมิกส์การวิเคราะห์การเสริมเส้นทางยีนแบบหลายออมิกส์การวิเคราะห์เมแทบอโลมิกส์แบบหลายออมิกส์การวิเคราะห์ความหลากหลายของไมโครไบโอมแบบหลายโอไมกส์การวิเคราะห์การเสริมเส้นทางชีวภาพแบบหลายโอมิกส์การวิเคราะห์โปรตีโอมิกส์แบบหลายออมิกส์การวิเคราะห์การแสดงออกแตกต่างกันของ RNA-seq แบบหลายโอห์มิกส์การวิเคราะห์ Single-Cell RNA-seq แบบ Multi-omicsการวิเคราะห์ความแปรผันของจำนวนสำเนาที่อิงเครือข่ายการวิเคราะห์การเสริมสร้างยีนเซตแบบอิงเครือข่ายการศึกษาความสัมพันธ์ทั่วทั้งจีโนมแบบอิงเครือข่ายการวิเคราะห์เมแทบอโลมิกส์แบบเครือข่ายการวิเคราะห์ความหลากหลายของจุลินทรีย์บนฐานเครือข่ายการวิเคราะห์การเสริมสมรรถนะวิถีชีวเคมีแบบอาศัยเครือข่ายการวิเคราะห์การแสดงออกที่แตกต่างกันของ RNA-seq โดยใช้เครือข่ายการวิเคราะห์ RNA-seq แบบเซลล์เดียวโดยอาศัยเครือข่ายการวิเคราะห์ความอุดมสมบูรณ์ของวิถีชีวภาพการวิเคราะห์โปรตีโอมิกส์การแสดงออกแตกต่างกันของ RNA-seqการวิเคราะห์การเสริมกลุ่มยีนระดับเซลล์เดี่ยวการวิเคราะห์ Single-cell RNA-seqSingle-cell RNA-seq differential expressionการวิเคราะห์การเสริมสร้างกลุ่มยีนอนุกรมเวลาการวิเคราะห์การเสริมเส้นทางอนุกรมเวลาการแสดงออกที่แตกต่างกันของ RNA-seq แบบอนุกรมเวลาการวิเคราะห์ข้อมูล RNA-seq ระดับเซลล์เดี่ยวแบบอนุกรมเวลา
ScholarGateGene Set Enrichment Analysis (Gene Set Enrichment Analysis). สืบค้นเมื่อ 2026-06-15 จาก https://scholargate.app/th/bioinformatics/gene-set-enrichment-analysis · ชุดข้อมูล: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026