Gene Set Enrichment Analysis (GSEA)
Gene Set Enrichment Analysis (GSEA) เป็นวิธีการคำนวณที่กำหนดว่าชุดของยีนที่กำหนดไว้ล่วงหน้า — ซึ่งแสดงถึงวิถีชีวภาพ กระบวนการ หรือหน้าที่ — แสดงความแตกต่างที่ประสานกันอย่างมีนัยสำคัญทางสถิติระหว่างสภาวะทางชีวภาพสองสภาวะ แตกต่างจากการกรองแบบ fold-change อย่างง่าย GSEA ดำเนินการกับยีนที่วัดได้ทั้งหมดที่จัดอันดับตามตัวชี้วัดความสัมพันธ์ ตรวจจับการเปลี่ยนแปลงที่ละเอียดอ่อนแต่สม่ำเสมอทั่วทั้งวิถีทั้งหมด แม้ว่าจะไม่มีการทดสอบยีนเดี่ยวใดผ่านเกณฑ์นัยสำคัญก็ตาม
อ่านวิธีฉบับเต็ม
เข้าสู่ระบบด้วยบัญชีฟรีเพื่ออ่านส่วนนี้
แผนที่ระเบียบวิธี
ย่านของระเบียบวิธีที่เกี่ยวข้องกัน — เลือกโหนดเพื่อสำรวจ
+27 เพิ่มเติม
แหล่งอ้างอิง
- Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
- Mootha, V. K., Lindgren, C. M., Eriksson, K. F., Subramanian, A., Sihag, S., Lehar, J., Puigserver, P., Carlsson, E., Ridderstrale, M., Laurila, E., Houstis, N., Daly, M. J., Patterson, N., Mesirov, J. P., Golub, T. R., Tamayo, P., Spiegelman, B., Lander, E. S., Hirschhorn, J. N., Altshuler, D., & Groop, L. C. (2003). PGC-1alpha-responsive genes involved in oxidative phosphorylation are coordinately downregulated in human diabetes. Nature Genetics, 34(3), 267–273. DOI: 10.1038/ng1180 ↗
วิธีอ้างอิงหน้านี้
ScholarGate. (2026, June 3). Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/th/bioinformatics/gene-set-enrichment-analysis
ระเบียบวิธีใด?
วางระเบียบวิธีนี้เคียงข้างระเบียบวิธีใกล้เคียงที่สุด แล้วอ่านเปรียบเทียบกัน — คลังวางหนังสือไว้บนโต๊ะให้แล้ว ส่วนการเลือกเป็นของท่าน
- การวิเคราะห์การเสริมเส้นทางยีนแบบหลายออมิกส์ชีวสารสนเทศศาสตร์↔ เปรียบเทียบ
- การวิเคราะห์การเสริมสร้างยีนเซตแบบอิงเครือข่ายชีวสารสนเทศศาสตร์↔ เปรียบเทียบ
- การวิเคราะห์ความอุดมสมบูรณ์ของวิถีชีวภาพชีวสารสนเทศศาสตร์↔ เปรียบเทียบ
- การแสดงออกแตกต่างกันของ RNA-seqชีวสารสนเทศศาสตร์↔ เปรียบเทียบ
- การวิเคราะห์ Single-cell RNA-seqชีวสารสนเทศศาสตร์↔ เปรียบเทียบ