การวิเคราะห์การเสริมสมรรถนะวิถีชีวเคมีแบบอาศัยเครือข่าย
การวิเคราะห์การเสริมสมรรถนะวิถีชีวเคมีแบบอาศัยเครือข่าย (Network-based pathway enrichment analysis) เป็นการบูรณาการเครือข่ายปฏิสัมพันธ์ระดับโมเลกุล ไม่ว่าจะเป็นปฏิสัมพันธ์ระหว่างโปรตีนกับโปรตีน กราฟการส่งสัญญาณ หรือเครือข่ายควบคุมยีน เข้ากับการวัดค่าทางโอไมกส์ เพื่อระบุวิถีชีวเคมีที่มีการเปลี่ยนแปลงร่วมกันภายใต้สภาวะหนึ่งๆ ซึ่งแตกต่างจากวิธีการเสริมสมรรถนะแบบคลาสสิกที่พิจารณายีนในวิถีชีวเคมีเป็นรายการอิสระ วิธีการกลุ่มนี้จะแพร่กระจายสัญญาณไปตามขอบของเครือข่าย ทำให้สามารถจับโครงสร้างปฏิสัมพันธ์และค้นพบโมดูลที่มีการควบคุมผิดปกติ ซึ่งวิธีการเสริมสมรรถนะแบบรายการทั่วไปไม่สามารถทำได้
อ่านวิธีฉบับเต็ม
เข้าสู่ระบบด้วยบัญชีฟรีเพื่ออ่านส่วนนี้
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
แหล่งอ้างอิง
- Ideker, T., Ozier, O., Schwikowski, B., & Siegel, A. F. (2002). Discovering regulatory and signalling circuits in molecular interaction networks. Bioinformatics, 18(suppl_1), S233–S240. link ↗
- Vaske, C. J., Benz, S. C., Sanborn, J. Z., Earl, D., Szeto, C., Zhu, J., Haussler, D., & Stuart, J. M. (2010). Inference of patient-specific pathway activities from multi-dimensional cancer genomics data using PARADIGM. Bioinformatics, 26(12), i237–i245. DOI: 10.1093/bioinformatics/btq182 ↗
วิธีอ้างอิงหน้านี้
ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Pathway Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/th/bioinformatics/network-based-pathway-enrichment-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Gene Set Enrichment Analysis (GSEA)ชีวสารสนเทศศาสตร์↔ compare