การวิเคราะห์ความแปรผันของจำนวนสำเนาที่อิงเครือข่าย
การวิเคราะห์ความแปรผันของจำนวนสำเนาที่อิงเครือข่าย (Network-based copy number variation analysis) ผสานข้อมูล CNV ทั่วทั้งจีโนมเข้ากับเครือข่ายปฏิสัมพันธ์ทางชีววิทยา เช่น เครือข่ายปฏิสัมพันธ์ระหว่างโปรตีน (PPI) หรือเครือข่ายวิถีชีวเคมี เพื่อระบุบริเวณที่มีความสอดคล้องทางหน้าที่ ยีนขับเคลื่อน และเครือข่ายย่อยที่เปลี่ยนแปลงไป ซึ่งการเรียกหา CNV แบบดิบเพียงอย่างเดียวอาจมองข้ามไป ด้วยการแพร่กระจายสัญญาณ CNV ผ่านกราฟเครือข่าย วิธีการนี้จะเผยให้เห็นความไม่สมดุลของปริมาณยีนที่ประสานกัน ซึ่งบรรจบกันที่หน้าที่ทางชีววิทยาที่เหมือนกัน ทำให้มีประสิทธิภาพอย่างยิ่งในการศึกษาจีโนมิกส์ของมะเร็งและโรคหายาก
อ่านวิธีฉบับเต็ม
เข้าสู่ระบบด้วยบัญชีฟรีเพื่ออ่านส่วนนี้
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
แหล่งอ้างอิง
- Vandin, F., Upfal, E., & Raphael, B. J. (2012). De novo discovery of mutated driver pathways in cancer. Genome Research, 22(2), 375–385. DOI: 10.1101/gr.120477.111 ↗
- Leiserson, M. D. M., Vandin, F., Wu, H.-T., Dobson, J. R., Eldridge, J. V., Thomas, J. L., Papoutsaki, A., Kim, Y., Niu, B., McLellan, M., Lawrence, M. S., Gonzalez-Perez, A., Tamborero, D., Cheng, Y., Ryslik, G. A., Lopez-Bigas, N., Getz, G., Ding, L., & Raphael, B. J. (2015). Pan-cancer network analysis identifies combinations of rare somatic mutations across pathways and protein complexes. Nature Genetics, 47(2), 106–114. DOI: 10.1038/ng.3168 ↗
วิธีอ้างอิงหน้านี้
ScholarGate. (2026, June 3). Network-Based Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/th/bioinformatics/network-based-copy-number-variation-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- การวิเคราะห์ความแปรผันของจำนวนสำเนาชีวสารสนเทศศาสตร์↔ compare
- Gene Set Enrichment Analysis (GSEA)ชีวสารสนเทศศาสตร์↔ compare
- การศึกษาความสัมพันธ์ทั่วทั้งจีโนมแบบอิงเครือข่ายชีวสารสนเทศศาสตร์↔ compare
- การวิเคราะห์การแสดงออกที่แตกต่างกันของ RNA-seq โดยใช้เครือข่ายชีวสารสนเทศศาสตร์↔ compare
- การวิเคราะห์ความอุดมสมบูรณ์ของวิถีชีวภาพชีวสารสนเทศศาสตร์↔ compare
- การระบุความแปรผันชีวสารสนเทศศาสตร์↔ compare