การวิเคราะห์ความหลากหลายของจุลินทรีย์บนฐานเครือข่าย
การวิเคราะห์ความหลากหลายของจุลินทรีย์บนฐานเครือข่าย (Network-based microbiome diversity analysis) เป็นการบูรณาการการอนุมานเครือข่ายการเกิดร่วม (co-occurrence network inference) โดยใช้ทฤษฎีกราฟเข้ากับดัชนีวัดความหลากหลายแบบอัลฟา (alpha-diversity) และเบตา (beta-diversity) แบบดั้งเดิม เพื่อจำแนกลักษณะโครงสร้างองค์กรของชุมชนจุลินทรีย์ แทนที่จะปฏิบัติต่อแต่ละกลุ่มของสิ่งมีชีวิต (taxon) ในฐานะหน่วยอิสระ วิธีการนี้จะจำลองความสัมพันธ์ระหว่างจุลินทรีย์เป็นคู่ ๆ ในรูปของเส้นเชื่อม (edges) ในเครือข่าย ทำให้สามารถระบุกลุ่มสิ่งมีชีวิตที่เป็นแกนหลัก (keystone taxa) กลุ่มย่อยของชุมชน (community modules) และรูปแบบปฏิสัมพันธ์ทางนิเวศวิทยาที่ดัชนีวัดความหลากหลายแบบธรรมดาไม่สามารถตรวจจับได้
อ่านวิธีฉบับเต็ม
เข้าสู่ระบบด้วยบัญชีฟรีเพื่ออ่านส่วนนี้
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
แหล่งอ้างอิง
- Friedman, J., & Alm, E. J. (2012). Inferring correlation networks from genomic survey data. PLoS Computational Biology, 8(9), e1002687. DOI: 10.1371/journal.pcbi.1002687 ↗
- Faust, K., & Raes, J. (2012). Microbial interactions: from networks to models. Nature Reviews Microbiology, 10(8), 538–550. DOI: 10.1038/nrmicro2832 ↗
วิธีอ้างอิงหน้านี้
ScholarGate. (2026, June 3). Network-Based Microbiome Diversity Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/th/bioinformatics/network-based-microbiome-diversity-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Gene Set Enrichment Analysis (GSEA)ชีวสารสนเทศศาสตร์↔ compare
- การวิเคราะห์การเสริมสมรรถนะวิถีชีวเคมีแบบอาศัยเครือข่ายชีวสารสนเทศศาสตร์↔ compare
- การวิเคราะห์ความอุดมสมบูรณ์ของวิถีชีวภาพชีวสารสนเทศศาสตร์↔ compare
- การวิเคราะห์วิวัฒนาการชาติพันธุ์ชีวสารสนเทศศาสตร์↔ compare
- การแสดงออกแตกต่างกันของ RNA-seqชีวสารสนเทศศาสตร์↔ compare