การวิเคราะห์ Single-cell RNA-seq — scRNA-seq

การวิเคราะห์ Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) เป็นการระบุลักษณะการแสดงออกของยีนในระดับเซลล์แต่ละเซลล์ ทำให้สามารถค้นพบชนิดของเซลล์ สภาวะ และการเปลี่ยนแปลงที่มองไม่เห็นในการวิเคราะห์ทรานสคริปโตมิกส์แบบรวม (bulk transcriptomics) โดยเริ่มจากข้อมูลลำดับเบสที่ได้จากการจัดลำดับ (raw sequencing reads) กระบวนการทำงานจะสร้างเมทริกซ์การนับเซลล์ต่อยีน (cell-by-gene count matrix) และดำเนินการผ่านการควบคุมคุณภาพ (quality control) การทำให้เป็นมาตรฐาน (normalisation) การลดมิติ (dimensionality reduction) การจัดกลุ่มแบบไม่กำกับดูแล (unsupervised clustering) การระบุชนิดเซลล์ (cell-type annotation) และการวิเคราะห์ขั้นปลายน้ำหลายอย่าง เช่น การอนุมานวิถีการพัฒนา (trajectory inference) และการแสดงออกที่แตกต่างกันระหว่างประชากรเซลล์ (differential expression between cell populations)