การวิเคราะห์การเสริมสร้างยีนเซตแบบอิงเครือข่าย
การวิเคราะห์การเสริมสร้างยีนเซตแบบอิงเครือข่าย (network GSEA) เป็นการขยายผล GSEA แบบดั้งเดิมโดยการรวมเครือข่ายปฏิสัมพันธ์ทางชีวภาพ เช่น โปรตีน-โปรตีน (PPI) หรือกราฟการแสดงออกร่วม (co-expression graphs) เข้ากับการทดสอบการเสริมสร้าง แทนที่จะพิจารณาแต่ละยีนอย่างอิสระ วิธีการนี้จะกระจายสัญญาณการแสดงออกที่แตกต่างกันไปตามขอบของเครือข่าย ทำให้ยีนที่มีการควบคุมร่วมกันหรือเชื่อมโยงกันตามหน้าที่สามารถสนับสนุนความสำคัญของยีนเซตได้พร้อมกัน ผลลัพธ์ที่ได้คือคะแนนการเสริมสร้างที่สอดคล้องกันทางชีวภาพซึ่งคำนึงถึงโทโพโลยีของวิถี (pathway) และการพึ่งพาอาศัยกันระหว่างยีน
อ่านวิธีฉบับเต็ม
เข้าสู่ระบบด้วยบัญชีฟรีเพื่ออ่านส่วนนี้
แผนที่ระเบียบวิธี
ย่านของระเบียบวิธีที่เกี่ยวข้องกัน — เลือกโหนดเพื่อสำรวจ
แหล่งอ้างอิง
- Shojaie, A., & Michailidis, G. (2010). Network enrichment analysis in complex experiments. Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology, 9(1), Article 22. link ↗
- Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545-15550. link ↗
วิธีอ้างอิงหน้านี้
ScholarGate. (2026, June 3). Network-Based Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/th/bioinformatics/network-based-gene-set-enrichment-analysis
ระเบียบวิธีใด?
วางระเบียบวิธีนี้เคียงข้างระเบียบวิธีใกล้เคียงที่สุด แล้วอ่านเปรียบเทียบกัน — คลังวางหนังสือไว้บนโต๊ะให้แล้ว ส่วนการเลือกเป็นของท่าน
- Gene Set Enrichment Analysis (GSEA)ชีวสารสนเทศศาสตร์↔ เปรียบเทียบ
- การศึกษาความสัมพันธ์ทั่วทั้งจีโนมแบบอิงเครือข่ายชีวสารสนเทศศาสตร์↔ เปรียบเทียบ
- การวิเคราะห์ความอุดมสมบูรณ์ของวิถีชีวภาพชีวสารสนเทศศาสตร์↔ เปรียบเทียบ
- การแสดงออกแตกต่างกันของ RNA-seqชีวสารสนเทศศาสตร์↔ เปรียบเทียบ
- การวิเคราะห์การเสริมกลุ่มยีนระดับเซลล์เดี่ยวชีวสารสนเทศศาสตร์↔ เปรียบเทียบ