Process / pipelineBioinformatics / omics

การวิเคราะห์ความหลากหลายของจุลินทรีย์แบบเบย์เซียน — การประเมินโครงสร้างชุมชนเชิงความน่าจะเป็น

การวิเคราะห์ความหลากหลายของจุลินทรีย์แบบเบย์เซียนประยุกต์ใช้แบบจำลองเชิงความน่าจะเป็น — โดยหลักคือ กรอบการทำงานแบบ Dirichlet-Multinomial และกรอบการทำงานแบบลำดับชั้นที่เกี่ยวข้อง — กับข้อมูลจำนวนนับของ 16S rRNA หรือ shotgun metagenomic เพื่อประเมิน alpha-diversity (ความหลากหลายและความสม่ำเสมอภายในตัวอย่าง) และ beta-diversity (ความแตกต่างขององค์ประกอบระหว่างตัวอย่าง) พร้อมทั้งส่งผ่านความไม่แน่นอนตลอดทั้งกระบวนการอนุมาน ซึ่งแตกต่างจากแนวทางที่ใช้การสุ่มตัวอย่างแบบ frequentist วิธีการแบบเบย์เซียนถือว่าจำนวนลำดับของสิ่งมีชีวิตเป็นตัวอย่างจากองค์ประกอบแฝง ทำให้สามารถคำนวณช่วงความเชื่อถือได้ (credible intervals) สำหรับตัวชี้วัดความหลากหลายและการเปรียบเทียบอย่างมีหลักการระหว่างกลุ่มที่มีความลึกของการจัดลำดับที่แตกต่างกัน

เปิดใน MethodMindเร็ว ๆ นี้วิดีโอเร็ว ๆ นี้Download slides

อ่านวิธีฉบับเต็ม

สำหรับสมาชิกเท่านั้น

เข้าสู่ระบบด้วยบัญชีฟรีเพื่ออ่านส่วนนี้

เข้าสู่ระบบ

Method map

The neighbourhood of related methods — select a node to explore.

แหล่งอ้างอิง

  1. Holmes, I., Harris, K., & Quince, C. (2012). Dirichlet Multinomial Mixtures: Generative Models for Microbial Metagenomics. PLOS ONE, 7(2), e30126. link
  2. La Rosa, P. S., Brooks, J. P., Deych, E., Boone, E. L., Edwards, D. J., Wang, Q., Sodergren, E., Weinstock, G., & Shannon, W. D. (2012). Hypothesis Testing and Power Calculations for Taxonomic-Based Human Microbiome Data. PLOS ONE, 7(12), e52078. link

วิธีอ้างอิงหน้านี้

ScholarGate. (2026, June 3). Bayesian Statistical Analysis of Microbiome Diversity. ScholarGate. https://scholargate.app/th/bioinformatics/bayesian-microbiome-diversity-analysis

Which method?

Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.

Compare side by side
ScholarGateBayesian Microbiome Diversity Analysis (Bayesian Statistical Analysis of Microbiome Diversity). สืบค้นเมื่อ 2026-06-15 จาก https://scholargate.app/th/bioinformatics/bayesian-microbiome-diversity-analysis · ชุดข้อมูล: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026