การวิเคราะห์ RNA-seq แบบเซลล์เดียวโดยอาศัยเครือข่าย
การวิเคราะห์ RNA-seq แบบเซลล์เดียวโดยอาศัยเครือข่าย (Network-based single-cell RNA-seq analysis) เป็นการต่อยอดเวิร์กโฟลว์ scRNA-seq มาตรฐาน โดยสร้างและตรวจสอบเครือข่ายปฏิสัมพันธ์ระดับโมเลกุล ไม่ว่าจะเป็นเครือข่ายควบคุมยีน (gene regulatory networks), เครือข่ายการแสดงออกร่วมกัน (co-expression networks) หรือกราฟการสื่อสารระหว่างเซลล์ (cell-cell communication graphs) จากข้อมูลทรานสคริปโตมิกส์แบบเซลล์เดียว แทนที่จะพิจารณายีนแต่ละตัวอย่างอิสระ วิธีการนี้จะจับกิจกรรมที่ประสานกันของวงจรยีนและวิถีการส่งสัญญาณระหว่างเซลล์ทั้งภายในและระหว่างประชากรเซลล์ ทำให้สามารถมองเห็นภาพรวมของการควบคุมการถอดรหัสในระดับระบบด้วยความละเอียดแบบเซลล์เดียว
อ่านวิธีฉบับเต็ม
เข้าสู่ระบบด้วยบัญชีฟรีเพื่ออ่านส่วนนี้
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
แหล่งอ้างอิง
- Aibar, S., González-Blas, C. B., Moerman, T., Huynh-Thu, V. A., Imrichova, H., Hulselmans, G., ... & Aerts, S. (2017). SCENIC: single-cell regulatory network inference and clustering. Nature Methods, 14(11), 1083–1086. link ↗
- Jin, S., Guerrero-Juarez, C. F., Zhang, L., Chang, I., Ramos, R., Kuan, C. H., ... & Nie, Q. (2021). Inference and analysis of cell-cell communication using CellChat. Nature Communications, 12(1), 1088. link ↗
วิธีอ้างอิงหน้านี้
ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/th/bioinformatics/network-based-single-cell-rna-seq-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Gene Set Enrichment Analysis (GSEA)ชีวสารสนเทศศาสตร์↔ compare
- การวิเคราะห์การแสดงออกที่แตกต่างกันของ RNA-seq โดยใช้เครือข่ายชีวสารสนเทศศาสตร์↔ compare
- การวิเคราะห์ความอุดมสมบูรณ์ของวิถีชีวภาพชีวสารสนเทศศาสตร์↔ compare
- การแสดงออกแตกต่างกันของ RNA-seqชีวสารสนเทศศาสตร์↔ compare
- Single-cell eQTL Analysisชีวสารสนเทศศาสตร์↔ compare
- การวิเคราะห์ Single-cell RNA-seqชีวสารสนเทศศาสตร์↔ compare