Process / pipelineBioinformatics / omics

Analýza obohatenia signálnych dráh — Analýza obohatenia biologických signálnych dráh

Analýza obohatenia signálnych dráh (PEA) je štatistický prístup, ktorý berie zoznam génov alebo proteínov záujmu — typicky odvodený z experimentu s diferenciálnou expresiou alebo proteomiky — a identifikuje, ktoré vopred definované biologické signálne dráhy alebo funkčné génové sady sú zastúpené častejšie, než by sa očakávalo náhodou. Mapovaním jednotlivých molekulárnych zmien na kurátorované znalostné bázy signálnych dráh, ako sú KEGG, Gene Ontology alebo Reactome, PEA prekladá dlhé zoznamy génov do interpretovateľných biologických procesov, čím sa stáva centrálnym nástrojom v post-analýze vysoko priepustných omických experimentov.

Otvoriť v MethodMindČoskoroVideoČoskoroStiahnuť snímky

Prečítať celú metódu

Len pre členov

Ak si chcete prečítať túto sekciu, prihláste sa s bezplatným účtom.

Prihlásiť sa

Mapa metód

Okolie príbuzných metód — vyberte uzol na preskúmanie.

Analýza obohatenia signálnych dráh

Analýza obohatenia genov…Analýza metabolomiky Sieťová analýza obohaten…Analýza proteómov Analýza diferenciálnej e…Analýza jednobunkovej RN…Bayesovské určovanie vrc…Bayesovská analýza eQTL Bayesovská analýza oboha…Bayesovská GWAS

+43 ďalších

Zdroje

Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
Alexa, A., Rahnenführer, J., & Lengauer, T. (2006). Improved scoring of functional groups from gene expression data by decorrelating GO graph structure. Bioinformatics, 22(13), 1600–1607. DOI: 10.1093/bioinformatics/btl140 ↗

Ako citovať túto stránku

ScholarGate. (2026, June 3). Biological Pathway Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/sk/bioinformatics/pathway-enrichment-analysis

Ktorá metóda?

Postavte túto metódu vedľa jej najbližších príbuzných a čítajte ich vedľa seba — knižnica vám knihy položí na stôl; voľba je na vás.

Analýza obohatenia genových súborov (GSEA)Bioinformatika↔ porovnať
Analýza metabolomikyBioinformatika↔ porovnať
Sieťová analýza obohatenia dráhBioinformatika↔ porovnať
Analýza proteómovBioinformatika↔ porovnať
Analýza diferenciálnej expresie RNA-seqBioinformatika↔ porovnať
Analýza jednobunkovej RNA-sekvenčnej analýzyBioinformatika↔ porovnať

Porovnať vedľa seba →

Odkazujú sem

Bayesovské určovanie vrcholov v ChIP-seq Bayesovská analýza eQTL Bayesovská analýza obohatenia génových súborov Bayesovská GWAS Bayesovská metabolomická analýza Bayesovská analýza obohatenia dráh Bayesovská proteomická analýza Bayesovská diferenciálna expresia RNA-seq Diferenciálna epigenómová asociatívna štúdia Diferenciálna analýza eQTL Diferenciálna metabolomická analýza Diferenciálna analýza obohatenia dráh Diferenciálna proteomická analýza Epigenóm-široká asociačná štúdia (EWAS)eQTL analýza Analýza obohatenia genových súborov (GSEA)Genómová asociačná štúdia (GWAS)Analýza eQTL s asistenciou strojového učenia Analýza obohacenia génových súborov asistovaná strojovým učením Strojové učenie asistovaná analýza diverzity mikrobiómu Diferenciálna expresná analýza RNA-seq s podporou strojového učenia Analýza jednobunkovej RNA-sekvencie s asistenciou strojového učenia Analýza metabolomiky Multiomická epigenómovo-široká asociačná štúdia Analýza obohatenia génových množín vo viacnásobných omických dátach Multi-omics metabolomics analysis Multiomická analýza diverzity mikrobiómu Analýza multi-omických proteomických dát Analýza multi-omických jednobunkových RNA-seq Sieťová analýza variácií počtu kópií Sieťovo orientovaná epigenómová asociačná štúdia (Network EWAS)Sieťovo orientovaná analýza eQTL Sieťová obohatená analýza génových súborov Sieťovo-založená GWAS Sieťová metabolomická analýza Sieťová analýza diverzity mikrobiómu Sieťovo orientovaná analýza diferenciálnej expresie RNA-seq Sieťová analýza jednotlivých bunkových RNA-sekvenčných dát Analýza proteómov Analýza diferenciálnej expresie RNA-seq Analýza eQTL jednobunkových dát Jednodimenzionálna analýza obohatenia génových súborov Single-cell GWAS Analýza metabolomiky jednotlivých buniek Analýza jednobunkovej RNA-sekvenčnej analýzy Diferenciálna expresná analýza jednobunkovej RNA-seq Analýza obohatenia génových súborov v časových radoch Analýza časových radov metabolomiky Analýza diverzity mikrobiómu časových radov Obohatenie dráh časových radov Diferenciálna expresia časových radov RNA-seq Analýza časových radov jednobunkovej RNA-sekvenčnej expresie

Našli ste na tejto stránke chybu? Nahláste ju alebo navrhnite opravu →