Analýza asociácií génov s genómom v kontexte jednotlivých buniek (Single-cell GWAS)
Single-cell GWAS je integračný bioinformatický pipeline, ktorý mapuje signály z genómových asociačných štúdií (GWAS) na krajiny transkriptómov jednotlivých buniek s cieľom identifikovať, ktoré typy buniek a jednotlivé bunky nesú neprimerane vysoké genetické riziko pre ochorenie alebo vlastnosť. Využitím atlasov transkriptómu jednotlivých buniek (scRNA-seq) spolu so súhrnnými štatistikami GWAS posúva analýzu za rámec asociácií na úrovni tkaniva a odhaľuje presné bunkové kontexty, v ktorých genetické varianty asociované s ochorením uplatňujú svoje účinky.
Prečítať celú metódu
Ak si chcete prečítať túto sekciu, prihláste sa s bezplatným účtom.
Mapa metód
Okolie príbuzných metód — vyberte uzol na preskúmanie.
Zdroje
- Zhang, M. J., Hou, K., Dey, K. K., Sakaue, S., Jagadeesh, K. A., Weinand, K., ... & Price, A. L. (2022). Polygenic enrichment distinguishes disease associations of individual cells in single-cell RNA-seq data. Nature Genetics, 54(8), 1224-1234. link ↗
- Bryois, J., Calini, D., Macnair, W., Foo, L., Urich, E., Ortmann, W., ... & De Jager, P. L. (2022). Cell-type-specific cis-eQTLs in eight human brain cell types identify novel risk genes for psychiatric and neurological disorders. Nature Neuroscience, 25(8), 1104-1112. link ↗
Ako citovať túto stránku
ScholarGate. (2026, June 3). Single-Cell Genome-Wide Association Study. ScholarGate. https://scholargate.app/sk/bioinformatics/single-cell-gwas
Ktorá metóda?
Postavte túto metódu vedľa jej najbližších príbuzných a čítajte ich vedľa seba — knižnica vám knihy položí na stôl; voľba je na vás.
- eQTL analýzaBioinformatika↔ porovnať
- Genómová asociačná štúdia (GWAS)Bioinformatika↔ porovnať
- Analýza obohatenia signálnych dráhBioinformatika↔ porovnať
- Analýza diferenciálnej expresie RNA-seqBioinformatika↔ porovnať
- Analýza eQTL jednobunkových dátBioinformatika↔ porovnať
- Analýza jednobunkovej RNA-sekvenčnej analýzyBioinformatika↔ porovnať
Odkazujú sem
Našli ste na tejto stránke chybu? Nahláste ju alebo navrhnite opravu →