Jednodimenzionálna analýza obohatenia génových súborov — scGSEA
Jednodimenzionálna analýza obohatenia génových súborov (scGSEA) rozširuje klasickú GSEA pre hromadné vzorky na rozlíšenie jednotlivých buniek. Namiesto testovania, či je génový súbor obohatený v porovnaní vzoriek na úrovni vzorky, scGSEA priraďuje skóre obohatenia alebo aktivity každej bunke, čo výskumníkom umožňuje mapovať aktivitu dráh naprieč heterogénnymi populáciami buniek, bunkovými stavmi a vývojovými trajektóriami zachytenými v jednobunkových RNA-sekvenčných dátach.
Prečítať celú metódu
Ak si chcete prečítať túto sekciu, prihláste sa s bezplatným účtom.
Mapa metód
Okolie príbuzných metód — vyberte uzol na preskúmanie.
Zdroje
- Aibar, S., Gonzalez-Blas, C. B., Moerman, T., Huynh-Thu, V. A., Imrichova, H., Hulselmans, G., Rambow, F., Marine, J.-C., Geurts, P., Aerts, J., van den Oord, J., Kalender Atak, Z., Wouters, J., & Aerts, S. (2017). SCENIC: Single-cell regulatory network inference and clustering. Nature Methods, 14(11), 1083-1086. link ↗
- DeTomaso, D., Jones, M. G., Subramaniam, M., Ashuach, T., Ye, C. J., & Yosef, N. (2019). Functional interpretation of single cell similarity maps. Nature Communications, 10(1), 4376. link ↗
Ako citovať túto stránku
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/sk/bioinformatics/single-cell-gene-set-enrichment-analysis
Ktorá metóda?
Postavte túto metódu vedľa jej najbližších príbuzných a čítajte ich vedľa seba — knižnica vám knihy položí na stôl; voľba je na vás.
- Analýza obohatenia genových súborov (GSEA)Bioinformatika↔ porovnať
- Analýza obohatenia signálnych dráhBioinformatika↔ porovnať
- Analýza diferenciálnej expresie RNA-seqBioinformatika↔ porovnať
- Analýza jednobunkovej RNA-sekvenčnej analýzyBioinformatika↔ porovnať
- Diferenciálna expresná analýza jednobunkovej RNA-seqBioinformatika↔ porovnať
Odkazujú sem
Similar methods
Našli ste na tejto stránke chybu? Nahláste ju alebo navrhnite opravu →