Sieťovo-založená GWAS — Sieťovo-založená celogenómová asociačná štúdia
Sieťovo-založená GWAS integruje výsledky konvenčnej celogenómovej asociačnej štúdie s dátami z biologických sietí — ako sú siete interakcií proteín-proteín (PPI) alebo grafy génovej koexpresie — s cieľom identifikovať gény alebo sub-siete relevantné pre ochorenia. Namiesto hlásenia len najvýznamnejších jednotlivých SNP, tento prístup šíri asociačné signály cez siete molekulárnych interakcií, čím odhaľuje zhluky génov, ktorých kolektívny signál ich zapája do biológie komplexných znakov, aj keď žiadny jednotlivý variant sám nedosahuje celogenómovú významnosť.
Prečítať celú metódu
Ak si chcete prečítať túto sekciu, prihláste sa s bezplatným účtom.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Zdroje
- Wang, Q., Yu, H., Zhao, Z., & Jia, P. (2015). EW_dmGWAS: edge-weighted dense module search for genome-wide association studies and gene expression profiles. Bioinformatics, 31(15), 2591–2594. link ↗
- Leiserson, M. D. M., Vandin, F., Wu, H.-T., Dobson, J. R., Eldridge, J. V., Thomas, J. L., Papoutsaki, A., Kim, Y., Niu, B., McLellan, M., Lawrence, M. S., Gonzalez-Perez, A., Tamborero, D., Cheng, Y., Ryslik, G. A., Lopez-Bigas, N., Getz, G., Ding, L., & Raphael, B. J. (2015). Pan-cancer network analysis identifies combinations of rare somatic mutations contributing to tumorigenesis. Nature Genetics, 47(2), 106–114. link ↗
Ako citovať túto stránku
ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Genome-Wide Association Study. ScholarGate. https://scholargate.app/sk/bioinformatics/network-based-gwas
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Analýza variácií počtu kópiíBioinformatika↔ compare
- eQTL analýzaBioinformatika↔ compare
- Analýza obohatenia genových súborov (GSEA)Bioinformatika↔ compare
- Genómová asociačná štúdia (GWAS)Bioinformatika↔ compare
- Sieťovo orientovaná analýza eQTLBioinformatika↔ compare
- Analýza obohatenia signálnych dráhBioinformatika↔ compare
Odkazujú sem
Našli ste na tejto stránke chybu? Nahláste ju alebo navrhnite opravu →