Analýza časových radov jednobunkovej RNA-sekvenčnej expresie — Temporálna transkriptomika s rozlíšením na jednobunkovej úrovni
Analýza časových radov jednobunkovej RNA-sekvenčnej expresie (scRNA-seq) zachytáva génovú expresiu vo viacerých časových bodoch s rozlíšením na jednobunkovej úrovni, aby odhalila, ako sa populácie buniek objavujú, prechádzajú a rozchádzajú počas dynamických biologických procesov, ako je vývoj, diferenciácia alebo progresia ochorenia. Kombináciou pseudočasového usporiadania, RNA rýchlosti a testovania diferenciálnej dynamiky výskumníci rekonštruujú časovú trajektóriu jednotlivých buniek a identifikujú génové regulačné zmeny, ktoré poháňajú biologické prechody.
Prečítať celú metódu
Ak si chcete prečítať túto sekciu, prihláste sa s bezplatným účtom.
Mapa metód
Okolie príbuzných metód — vyberte uzol na preskúmanie.
Zdroje
- Trapnell, C., Cacchiarelli, D., Grimsby, J., Pokharel, P., Li, S., Morse, M., Lennon, N. J., Livak, K. J., Mikkelsen, T. S., & Rinn, J. L. (2014). The dynamics and regulators of cell fate decisions are revealed by pseudotemporal ordering of single cells. Nature Biotechnology, 32(4), 381-386. DOI: 10.1038/nbt.2859 ↗
- La Manno, G., Soldatov, R., Zeisel, A., Braun, E., Hochgerner, H., Petukhov, V., Lidschreiber, K., Kastriti, M. E., Lonnerberg, P., Furlan, A., Fan, J., Borm, L. E., Liu, Z., van Bruggen, D., Guo, J., He, X., Linnarsson, S., & Kharchenko, P. V. (2018). RNA velocity of single cells. Nature, 560(7719), 494-498. DOI: 10.1038/s41586-018-0414-6 ↗
Ako citovať túto stránku
ScholarGate. (2026, June 3). Time-Series Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/sk/bioinformatics/time-series-single-cell-rna-seq-analysis
Ktorá metóda?
Postavte túto metódu vedľa jej najbližších príbuzných a čítajte ich vedľa seba — knižnica vám knihy položí na stôl; voľba je na vás.
- Analýza variácií počtu kópiíBioinformatika↔ porovnať
- eQTL analýzaBioinformatika↔ porovnať
- Analýza obohatenia genových súborov (GSEA)Bioinformatika↔ porovnať
- Analýza obohatenia signálnych dráhBioinformatika↔ porovnať
- Analýza diferenciálnej expresie RNA-seqBioinformatika↔ porovnať
- Analýza jednobunkovej RNA-sekvenčnej analýzyBioinformatika↔ porovnať
Odkazujú sem
Similar methods
Našli ste na tejto stránke chybu? Nahláste ju alebo navrhnite opravu →