Sieťová analýza obohatenia dráh
Sieťová analýza obohatenia dráh integruje molekulárne interakčné siete — interakcie proteín-proteín, signálne grafy alebo génové regulačné siete — s omických meraní na identifikáciu biologických dráh, ktoré sú koordinovane zmenené v danej podmienke. Na rozdiel od klasických prístupov nadmerného zastúpenia alebo obohatenia génových súprav, ktoré považujú gény dráh za nezávislé zoznamy, táto rodina metód propaguje signály cez okraje siete, zachytáva topológiu interakcií a odhaľuje dysregulované moduly, ktoré by obohatenie plochých zoznamov prehliadlo.
Prečítať celú metódu
Ak si chcete prečítať túto sekciu, prihláste sa s bezplatným účtom.
Mapa metód
Okolie príbuzných metód — vyberte uzol na preskúmanie.
Zdroje
- Ideker, T., Ozier, O., Schwikowski, B., & Siegel, A. F. (2002). Discovering regulatory and signalling circuits in molecular interaction networks. Bioinformatics, 18(suppl_1), S233–S240. link ↗
- Vaske, C. J., Benz, S. C., Sanborn, J. Z., Earl, D., Szeto, C., Zhu, J., Haussler, D., & Stuart, J. M. (2010). Inference of patient-specific pathway activities from multi-dimensional cancer genomics data using PARADIGM. Bioinformatics, 26(12), i237–i245. DOI: 10.1093/bioinformatics/btq182 ↗
Ako citovať túto stránku
ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Pathway Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/sk/bioinformatics/network-based-pathway-enrichment-analysis
Ktorá metóda?
Postavte túto metódu vedľa jej najbližších príbuzných a čítajte ich vedľa seba — knižnica vám knihy položí na stôl; voľba je na vás.
- Analýza obohatenia genových súborov (GSEA)Bioinformatika↔ porovnať
Odkazujú sem
Našli ste na tejto stránke chybu? Nahláste ju alebo navrhnite opravu →