Process / pipelineBioinformatics / omics

Sieťová analýza diverzity mikrobiómu

Sieťová analýza diverzity mikrobiómu integruje inferenciu ko-okurenčných sietí založenú na teórii grafov s klasickými metrikami alfa- a beta-diverzity na charakterizáciu štrukturálnej organizácie mikrobiálnych komunít. Namiesto toho, aby sa taxóny považovali za nezávislé entity, metóda modeluje párové asociácie mikróbov ako hrany v sieti, čo umožňuje identifikáciu kľúčových taxónov, komunitných modulov a vzorcov ekologických interakcií, ktoré jednoduché indexy diverzity nedokážu odhaliť.

Otvoriť v MethodMindČoskoroVideoČoskoroDownload slides

Prečítať celú metódu

Len pre členov

Ak si chcete prečítať túto sekciu, prihláste sa s bezplatným účtom.

Prihlásiť sa

Method map

The neighbourhood of related methods — select a node to explore.

Zdroje

  1. Friedman, J., & Alm, E. J. (2012). Inferring correlation networks from genomic survey data. PLoS Computational Biology, 8(9), e1002687. DOI: 10.1371/journal.pcbi.1002687
  2. Faust, K., & Raes, J. (2012). Microbial interactions: from networks to models. Nature Reviews Microbiology, 10(8), 538–550. DOI: 10.1038/nrmicro2832

Ako citovať túto stránku

ScholarGate. (2026, June 3). Network-Based Microbiome Diversity Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/sk/bioinformatics/network-based-microbiome-diversity-analysis

Which method?

Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.

Compare side by side

Odkazujú sem

ScholarGateNetwork-based microbiome diversity analysis (Network-Based Microbiome Diversity Analysis). Získané 2026-06-15 z https://scholargate.app/sk/bioinformatics/network-based-microbiome-diversity-analysis · Dátová sada: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026