Process / pipelineBioinformatics / omics

Analýza obohatenia genových súborov (GSEA)

Analýza obohatenia genových súborov (GSEA) je výpočtová metóda, ktorá určuje, či preddefinovaný súbor génov – reprezentujúci biologickú dráhu, proces alebo funkciu – vykazuje štatisticky významné, koordinované rozdiely medzi dvoma biologickými podmienkami. Na rozdiel od jednoduchého filtrovania podľa fold-zmeny, GSEA pracuje so všetkými meranými génmi zoradenými podľa metriky korelácie, pričom deteguje jemné, ale konzistentné posuny v celej dráhe, aj keď žiadny jednotlivý gén nedosiahne prahovú hodnotu významnosti.

Otvoriť v MethodMindČoskoroApply, compare, get guidance

Tools & resources

Stiahnuť snímky

Learn & explore

VideoČoskoro

Prečítať celú metódu

Len pre členov

Ak si chcete prečítať túto sekciu, prihláste sa s bezplatným účtom.

Prihlásiť sa

Mapa metód

Okolie príbuzných metód — vyberte uzol na preskúmanie.

Analýza obohatenia genových súborov (GSEA)

Analýza obohatenia génov…Sieťová obohatená analýz…Analýza obohatenia signá…Analýza diferenciálnej e…Analýza jednobunkovej RN…Bayesovská analýza oboha…Bayesovská analýza diver…Bayesovská analýza oboha…Bayesovská diferenciálna…Diferenciálne volanie vr…

+27 ďalších

Zdroje

Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
Mootha, V. K., Lindgren, C. M., Eriksson, K. F., Subramanian, A., Sihag, S., Lehar, J., Puigserver, P., Carlsson, E., Ridderstrale, M., Laurila, E., Houstis, N., Daly, M. J., Patterson, N., Mesirov, J. P., Golub, T. R., Tamayo, P., Spiegelman, B., Lander, E. S., Hirschhorn, J. N., Altshuler, D., & Groop, L. C. (2003). PGC-1alpha-responsive genes involved in oxidative phosphorylation are coordinately downregulated in human diabetes. Nature Genetics, 34(3), 267–273. DOI: 10.1038/ng1180 ↗

Ako citovať túto stránku

ScholarGate. (2026, June 3). Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/sk/bioinformatics/gene-set-enrichment-analysis

Ktorá metóda?

Postavte túto metódu vedľa jej najbližších príbuzných a čítajte ich vedľa seba — knižnica vám knihy položí na stôl; voľba je na vás.

Analýza obohatenia génových množín vo viacnásobných omických dátachBioinformatika↔ porovnať
Sieťová obohatená analýza génových súborovBioinformatika↔ porovnať
Analýza obohatenia signálnych dráhBioinformatika↔ porovnať
Analýza diferenciálnej expresie RNA-seqBioinformatika↔ porovnať
Analýza jednobunkovej RNA-sekvenčnej analýzyBioinformatika↔ porovnať

Porovnať vedľa seba →

Odkazujú sem

Bayesovská analýza obohatenia génových súborov Bayesovská analýza diverzity mikrobiómu Bayesovská analýza obohatenia dráh Bayesovská diferenciálna expresia RNA-seq Diferenciálne volanie vrcholkov v ChIP-seq Diferenciálna analýza obohatenia dráh eQTL analýza Analýza obohacenia génových súborov asistovaná strojovým učením Analýza obohacovania dráh asistovaná strojovým učením Diferenciálna expresná analýza RNA-seq s podporou strojového učenia Analýza jednobunkovej RNA-sekvencie s asistenciou strojového učenia Analýza metabolomiky Analýza obohatenia génových množín vo viacnásobných omických dátach Multi-omics metabolomics analysis Multiomická analýza diverzity mikrobiómu Analýza obohatenia multi-omických dráh Analýza multi-omických proteomických dát Viacnásobná analýza expresie génov RNA-seq Analýza multi-omických jednobunkových RNA-seq Sieťová analýza variácií počtu kópií Sieťová obohatená analýza génových súborov Sieťovo-založená GWAS Sieťová metabolomická analýza Sieťová analýza diverzity mikrobiómu Sieťová analýza obohatenia dráh Sieťovo orientovaná analýza diferenciálnej expresie RNA-seq Sieťová analýza jednotlivých bunkových RNA-sekvenčných dát Analýza obohatenia signálnych dráh Analýza proteómov Analýza diferenciálnej expresie RNA-seq Jednodimenzionálna analýza obohatenia génových súborov Analýza jednobunkovej RNA-sekvenčnej analýzy Diferenciálna expresná analýza jednobunkovej RNA-seq Analýza obohatenia génových súborov v časových radoch Obohatenie dráh časových radov Diferenciálna expresia časových radov RNA-seq Analýza časových radov jednobunkovej RNA-sekvenčnej expresie

Related reference concepts

Pathway Enrichment and Network Analysis Functional Genomics and Pathway Analysis Gene Ontology and Biological Databases Gene Expression Signatures and Prognostic Markers Transcriptomics and Gene Expression Analysis Systems Genomics and Network Biology

Našli ste na tejto stránke chybu? Nahláste ju alebo navrhnite opravu →