Sieťová analýza variácií počtu kópií
Sieťová analýza variácií počtu kópií (CNV) integruje celogenómové údaje CNV s biologickými interakčnými sieťami — ako sú siete interakcií proteín-proteín (PPI) alebo signálne dráhy — na identifikáciu funkčne koherentných regiónov, génov riadiacich ochorenie a pozmenených pod-sietí, ktoré by samotné surové volanie CNV prehliadlo. Propagáciou signálov CNV cez graf siete táto metóda odhaľuje koordinované nerovnováhy v dávkovaní génov, ktoré sa zbiehajú k spoločným biologickým funkciám, čo ju robí obzvlášť silnou v onkologickej genómi a pri štúdiách zriedkavých chorôb.
Prečítať celú metódu
Ak si chcete prečítať túto sekciu, prihláste sa s bezplatným účtom.
Mapa metód
Okolie príbuzných metód — vyberte uzol na preskúmanie.
Zdroje
- Vandin, F., Upfal, E., & Raphael, B. J. (2012). De novo discovery of mutated driver pathways in cancer. Genome Research, 22(2), 375–385. DOI: 10.1101/gr.120477.111 ↗
- Leiserson, M. D. M., Vandin, F., Wu, H.-T., Dobson, J. R., Eldridge, J. V., Thomas, J. L., Papoutsaki, A., Kim, Y., Niu, B., McLellan, M., Lawrence, M. S., Gonzalez-Perez, A., Tamborero, D., Cheng, Y., Ryslik, G. A., Lopez-Bigas, N., Getz, G., Ding, L., & Raphael, B. J. (2015). Pan-cancer network analysis identifies combinations of rare somatic mutations across pathways and protein complexes. Nature Genetics, 47(2), 106–114. DOI: 10.1038/ng.3168 ↗
Ako citovať túto stránku
ScholarGate. (2026, June 3). Network-Based Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/sk/bioinformatics/network-based-copy-number-variation-analysis
Ktorá metóda?
Postavte túto metódu vedľa jej najbližších príbuzných a čítajte ich vedľa seba — knižnica vám knihy položí na stôl; voľba je na vás.
- Analýza variácií počtu kópiíBioinformatika↔ porovnať
- Analýza obohatenia genových súborov (GSEA)Bioinformatika↔ porovnať
- Sieťovo-založená GWASBioinformatika↔ porovnať
- Sieťovo orientovaná analýza diferenciálnej expresie RNA-seqBioinformatika↔ porovnať
- Analýza obohatenia signálnych dráhBioinformatika↔ porovnať
- Variant CallingBioinformatika↔ porovnať
Našli ste na tejto stránke chybu? Nahláste ju alebo navrhnite opravu →