Process / pipelineBioinformatics / omics

Analýza jednobunkovej RNA-sekvenčnej analýzy — scRNA-seq

Analýza jednobunkovej RNA-sekvenčnej analýzy (scRNA-seq) charakterizuje génovú expresiu na úrovni rozlíšenia jednotlivých buniek, čo umožňuje objaviť typy, stavy a prechody buniek, ktoré sú v hromadnej transkriptomike neviditeľné. Počnúc surovými sekvenačnými čítaniami, pracovný postup produkuje maticu počtov buniek na gén a pokračuje cez kontrolu kvality, normalizáciu, redukciu dimenzionality, bez dohľadu zoskupovanie, anotáciu typov buniek a rad následných analýz, ako je inferencia trajektórie a diferenciálna expresia medzi populáciami buniek.

Otvoriť v MethodMindČoskoroVideoČoskoroDownload slides

Prečítať celú metódu

Len pre členov

Ak si chcete prečítať túto sekciu, prihláste sa s bezplatným účtom.

Prihlásiť sa

Method map

The neighbourhood of related methods — select a node to explore.

Analýza jednobunkovej RNA-sekvenčnej analýzy

Analýza obohatenia genov…Analýza obohatenia signá…Analýza diferenciálnej e…Analýza eQTL jednobunkov…Jednobunkové volanie var…Bayesovská diferenciálna…ChIP-seq Peak Calling Diferenciálna analýza je…eQTL analýza Volanie vrhcolov ChIP-se…

+19 more

Zdroje

Satija, R., Farrell, J. A., Gennert, D., Schier, A. F., & Regev, A. (2015). Spatial reconstruction of single-cell gene expression data. Nature Biotechnology, 33(5), 495–502. DOI: 10.1038/nbt.3192 ↗
Macosko, E. Z., Basu, A., Satija, R., Nemesh, J., Shekhar, K., Goldman, M., ... & McCarroll, S. A. (2015). Highly parallel genome-wide expression profiling of individual cells using nanoliter droplets. Cell, 161(5), 1202–1214. DOI: 10.1016/j.cell.2015.05.002 ↗

Ako citovať túto stránku

ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/sk/bioinformatics/single-cell-rna-seq-analysis

Which method?

Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.

Analýza obohatenia genových súborov (GSEA)Bioinformatika↔ compare
Analýza obohatenia signálnych dráhBioinformatika↔ compare
Analýza diferenciálnej expresie RNA-seqBioinformatika↔ compare
Analýza eQTL jednobunkových dátBioinformatika↔ compare
Jednobunkové volanie variantovBioinformatika↔ compare

Compare side by side →

Odkazujú sem

Bayesovská diferenciálna expresia RNA-seq ChIP-seq Peak Calling Diferenciálna analýza jednobunkovej RNA-seq eQTL analýza Analýza obohatenia genových súborov (GSEA)Volanie vrhcolov ChIP-seq s asistenciou strojového učenia Analýza obohacenia génových súborov asistovaná strojovým učením Diferenciálna expresná analýza RNA-seq s podporou strojového učenia Analýza jednobunkovej RNA-sekvencie s asistenciou strojového učenia Analýza multi-omických jednobunkových RNA-seq Sieťovo orientovaná analýza diferenciálnej expresie RNA-seq Sieťová analýza jednotlivých bunkových RNA-sekvenčných dát Analýza obohatenia signálnych dráh Analýza diferenciálnej expresie RNA-seq Zarovnávanie sekvencií Volanie pík v rámci profilovania epigenómu scChIP-seq Analýza variácií počtu kópií v jednotlivých bunkách Analýza eQTL jednobunkových dát Jednodimenzionálna analýza obohatenia génových súborov Single-cell GWAS Analýza metabolomiky jednotlivých buniek Analýza diverzity mikrobiómu na úrovni jednotlivých buniek Analýza fylogenézy jednobunkových organizmov Diferenciálna expresná analýza jednobunkovej RNA-seq Analýza obohatenia génových súborov v časových radoch Analýza diverzity mikrobiómu časových radov Diferenciálna expresia časových radov RNA-seq Analýza časových radov jednobunkovej RNA-sekvenčnej expresie

Našli ste na tejto stránke chybu? Nahláste ju alebo navrhnite opravu →