Analýza multi-omických jednobunkových RNA-seq — Integratívna multimodálna jednobunková profilácia
Analýza multi-omických jednobunkových RNA-seq integruje dve alebo viac molekulárnych vrstiev — ako je génová expresia (scRNA-seq), dostupnosť chromatínu (scATAC-seq) alebo abundancia povrchových proteínov (CITE-seq) — meraných súčasne alebo spoločne profilovaných v rovnakých jednotlivých bunkách. Zosúladením týchto modalít v zdieľanom nízkorozmernom priestore získavajú výskumníci mechanisticky bohatší obraz o identite buniek, regulačnom stave a fenotypoch, než aký môže poskytnúť akýkoľvek samostatný test.
Prečítať celú metódu
Ak si chcete prečítať túto sekciu, prihláste sa s bezplatným účtom.
Mapa metód
Okolie príbuzných metód — vyberte uzol na preskúmanie.
Zdroje
- Hao, Y., Hao, S., Andersen-Nissen, E., Mauck, W. M., Zheng, S., Butler, A., Lee, M. J., Wilk, A. J., Darby, C., Zager, M., Hoffman, P., Stoeckius, M., Papalexi, E., Mimitou, E. P., Jain, J., Srivastava, A., Stuart, T., Fleming, L. M., Yeung, B., Rogers, A. J., McElrath, J. M., Blish, C. A., Gottardo, R., Smibert, P., & Satija, R. (2021). Integrated analysis of multimodal single-cell data. Cell, 184(13), 3573–3587.e29. link ↗
- Argelaguet, R., Arnol, D., Bredikhin, D., Deloro, Y., Velten, B., Marioni, J. C., & Stegle, O. (2020). MOFA+: a statistical framework for comprehensive integration of multi-modal single-cell data. Genome Biology, 21(1), 111. link ↗
Ako citovať túto stránku
ScholarGate. (2026, June 3). Multi-omics Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/sk/bioinformatics/multi-omics-single-cell-rna-seq-analysis
Ktorá metóda?
Postavte túto metódu vedľa jej najbližších príbuzných a čítajte ich vedľa seba — knižnica vám knihy položí na stôl; voľba je na vás.
- ChIP-seq Peak CallingBioinformatika↔ porovnať
- Analýza obohatenia genových súborov (GSEA)Bioinformatika↔ porovnať
- Viacnásobná analýza expresie génov RNA-seqBioinformatika↔ porovnať
- Analýza obohatenia signálnych dráhBioinformatika↔ porovnať
- Analýza diferenciálnej expresie RNA-seqBioinformatika↔ porovnať
- Analýza jednobunkovej RNA-sekvenčnej analýzyBioinformatika↔ porovnať
Našli ste na tejto stránke chybu? Nahláste ju alebo navrhnite opravu →