Variant Calling — Chamada de Variantes Genômicas
Variant calling é o processo computacional de identificar posições em um genoma sequenciado que diferem de uma sequência de referência — incluindo polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs), pequenas inserções e deleções (indels) e variantes estruturais. Ele transforma leituras de sequenciamento alinhadas em um catálogo interpretável de diferenças genéticas, formando a base para genética de populações, descoberta de genes de doenças e aplicações de genômica clínica.
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Fontes
- McKenna, A., Hanna, M., Banks, E., Sivachenko, A., Cibulskis, K., Kernytsky, A., ... & DePristo, M. A. (2010). The Genome Analysis Toolkit: A MapReduce framework for analyzing next-generation DNA sequencing data. Genome Research, 20(9), 1297–1303. DOI: 10.1101/gr.107524.110 ↗
- Li, H., Handsaker, B., Wysoker, A., Fennell, T., Ruan, J., Homer, N., ... & Durbin, R. (2009). The Sequence Alignment/Map format and SAMtools. Bioinformatics, 25(16), 2078–2079. DOI: 10.1093/bioinformatics/btp352 ↗
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ScholarGate. (2026, June 3). Genomic Variant Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/pt/bioinformatics/variant-calling
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