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ChIP-seq Peak Calling — Chamada de Picos em Sequenciamento de Imunoprecipitação de Cromatina (ChIP-seq)

A chamada de picos em ChIP-seq é um pipeline computacional que identifica regiões genômicas onde uma proteína de interesse — um fator de transcrição ou uma modificação de histona — está enriquecida, com base em leituras de sequenciamento de experimentos de imunoprecipitação de cromatina. Ela converte dados brutos de sequenciamento em um conjunto de sítios de ligação ou modificação de alta confiança em todo o genoma, permitindo a análise a jusante da regulação gênica, do estado da cromatina e dos mecanismos epigenéticos.

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Fontes

  1. Zhang, Y., Liu, T., Meyer, C. A., Eeckhoute, J., Johnson, D. S., Bernstein, B. E., Nusbaum, C., Myers, R. M., Brown, M., Li, W., & Liu, X. S. (2008). Model-based analysis of ChIP-seq (MACS). Genome Biology, 9(9), R137. DOI: 10.1186/gb-2008-9-9-r137
  2. Landt, S. G., Marinov, G. K., Kundaje, A., Kheradpour, P., Pauli, F., Batzoglou, S., Bernstein, B. E., Bickel, P., Brown, J. B., Cayting, P., Chen, Y., DeSalvo, G., Epstein, C., Fisher-Aylor, K. I., Euskirchen, G., Gerstein, M., Gertz, J., Hartemink, A. J., Hoffman, M. M., ... Snyder, M. (2012). ChIP-seq guidelines and practices of the ENCODE and modENCODE consortia. Genome Research, 22(9), 1813–1831. DOI: 10.1101/gr.136184.111

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ScholarGate. (2026, June 3). Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Peak Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/pt/bioinformatics/chip-seq-peak-calling

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ScholarGateChIP-seq Peak Calling (Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Peak Calling). Recuperado em 2026-06-15 de https://scholargate.app/pt/bioinformatics/chip-seq-peak-calling · Conjunto de dados: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026