Análise de Variação do Número de Cópias Baseada em Rede
A análise de variação do número de cópias (VNC) baseada em rede integra dados de VNC genômicos com redes de interação biológica — como redes de interação proteína-proteína (IPP) ou de vias — para identificar regiões funcionalmente coerentes, genes condutores e sub-redes alteradas que a simples detecção de VNC bruta não conseguiria. Ao propagar sinais de VNC através do grafo da rede, o método revela desequilíbrios coordenados de dosagem genômica que convergem em funções biológicas comuns, tornando-o especialmente poderoso em genômica do câncer e estudos de doenças raras.
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Fontes
- Vandin, F., Upfal, E., & Raphael, B. J. (2012). De novo discovery of mutated driver pathways in cancer. Genome Research, 22(2), 375–385. DOI: 10.1101/gr.120477.111 ↗
- Leiserson, M. D. M., Vandin, F., Wu, H.-T., Dobson, J. R., Eldridge, J. V., Thomas, J. L., Papoutsaki, A., Kim, Y., Niu, B., McLellan, M., Lawrence, M. S., Gonzalez-Perez, A., Tamborero, D., Cheng, Y., Ryslik, G. A., Lopez-Bigas, N., Getz, G., Ding, L., & Raphael, B. J. (2015). Pan-cancer network analysis identifies combinations of rare somatic mutations across pathways and protein complexes. Nature Genetics, 47(2), 106–114. DOI: 10.1038/ng.3168 ↗
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ScholarGate. (2026, June 3). Network-Based Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/pt/bioinformatics/network-based-copy-number-variation-analysis
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