Análise Filogenética de Célula Única — Reconstrução de Árvore de Linhagem com Resolução de Célula Única
A análise filogenética de célula única reconstrói árvores evolutivas ou de desenvolvimento a partir de dados de sequenciamento de célula única, rastreando como células individuais divergiram de um ancestral comum. Ao alavancar mutações somáticas, códigos de barras introduzidos por CRISPR ou alterações no número de cópias como caracteres herdáveis, este método mapeia relações clonais dentro de tumores, tecidos em desenvolvimento ou repertórios imunes com uma resolução celular sem precedentes.
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Fontes
- Jones, M. G., Khodaverdian, A., Quinn, J. J., Chan, M. M., Hussmann, J. A., Wang, R., Xu, C., Weissman, J. S., & Yosef, N. (2020). Inference of single-cell phylogenies from lineage tracing data using Cassiopeia. Genome Biology, 21(1), 92. DOI: 10.1186/s13059-020-02000-8 ↗
- Trapnell, C., Cacchiarelli, D., Grimsby, J., Pokharel, P., Li, S., Morse, M., Lennon, N. J., Livak, K. J., Mikkelsen, T. S., & Rinn, J. L. (2014). The dynamics and regulators of cell fate decisions are revealed by pseudotemporal ordering of single cells. Nature Biotechnology, 32(4), 381-386. DOI: 10.1038/nbt.2859 ↗
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ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Phylogenetic and Lineage Tree Reconstruction. ScholarGate. https://scholargate.app/pt/bioinformatics/single-cell-phylogenetic-analysis
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- Análise de Variação do Número de CópiasBioinformática↔ comparar
- Análise FilogenéticaBioinformática↔ comparar
- Análise de RNA-seq de célula únicaBioinformática↔ comparar
- Variant CallingBioinformática↔ comparar
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