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유전자 집합 농축 분석 (GSEA)
유전자 집합 농축 분석 (GSEA)은 미리 정의된 유전자 집합 — 생물학적 경로, 과정 또는 기능을 나타내는 — 이 두 가지 생물학적 조건 간에 통계적으로 유의미하고 조정된 차이를 보이는지 결정하는 계산 방법입니다. 단순한 배수 변화 필터링과 달리, GSEA는 상관 관계 지표에 의해 순위가 매겨진 모든 측정된 유전자를 대상으로 작동하며, 단일 유전자가 유의성 임계값을 통과하지 못하더라도 전체 경로에 걸쳐 미묘하지만 일관된 변화를 감지합니다.
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출처
- Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
- Mootha, V. K., Lindgren, C. M., Eriksson, K. F., Subramanian, A., Sihag, S., Lehar, J., Puigserver, P., Carlsson, E., Ridderstrale, M., Laurila, E., Houstis, N., Daly, M. J., Patterson, N., Mesirov, J. P., Golub, T. R., Tamayo, P., Spiegelman, B., Lander, E. S., Hirschhorn, J. N., Altshuler, D., & Groop, L. C. (2003). PGC-1alpha-responsive genes involved in oxidative phosphorylation are coordinately downregulated in human diabetes. Nature Genetics, 34(3), 267–273. DOI: 10.1038/ng1180 ↗
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ScholarGate. (2026, June 3). Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ko/bioinformatics/gene-set-enrichment-analysis
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