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네트워크 기반 유전자 집합 농축 분석
네트워크 기반 유전자 집합 농축 분석(network GSEA)은 생물학적 상호작용 네트워크 — 예를 들어 단백질-단백질 상호작용(PPI) 또는 공동 발현 그래프 — 를 농축 검정에 통합함으로써 고전적 GSEA를 확장합니다. 각 유전자를 독립적으로 취급하는 대신, 이 방법은 네트워크 엣지를 가로질러 차등 발현 신호를 전파하여, 공동 조절되거나 기능적으로 연결된 유전자들이 유전자 집합의 중요성을 공동으로 지지하도록 합니다. 그 결과는 경로 위상과 유전자-유전자 의존성을 고려하는 생물학적으로 일관된 농축 점수입니다.
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출처
- Shojaie, A., & Michailidis, G. (2010). Network enrichment analysis in complex experiments. Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology, 9(1), Article 22. link ↗
- Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545-15550. link ↗
이 페이지 인용 방법
ScholarGate. (2026, June 3). Network-Based Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ko/bioinformatics/network-based-gene-set-enrichment-analysis
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